Самолёт имел шасси велосипедного типа с поддерживающими стойками на законцовках консолей.
В пилотировании самолёт сложности не представлял, вывозная программа не превышала трёх-четырёх полётов, и лишь посадка с боковым ветром из-за особенностей схемы шасси вызывала затруднения.
С апреля 1956 г. самолёты Як-25М находились на вооружении 324-го иап 107-й иад авиации СФ и одного полка авиации БФ. В 1958 г. самолёты Як-25М были переданы в ВВС СА.
Начало и середина 50-х гг. ознаменовались также усиленным использованием разведывательными службами США дрейфующих аэростатов с целью получения информации разведывательного характера в результате их пролёта над территорией СССР с маршрутным фотографированием. Полёт таких аэростатов осуществлялся с использованием струйных течений, скорость которых может достигать сотен километров в час, а направление зависит от высоты, времени года, суток и других факторов.
Для уничтожения "пузырей", как их именовали лётчики, поднимались самолёты-истребители, но иногда высота полёта аэростатов превосходила потолок истребителей. В связи с этим приходилось насколько можно снижать полётный вес самолётов, в том числе и за счёт заправки топливом. Потолок облегчённого МиГ-1 7 достигал, например, 17 000 м, МиГ-19 – 19 000 м. Кроме того, провели специальные исследования, чтобы выработать рекомендации лётчикам по методике учёта понижения траектории при стрельбе на кабрировании, а тем более на больших высотах. И задача перехвата и уничтожения дрейфующих аэростатов стала решаться довольно успешно. В 1956 г. первый аэростат сбил старший лейтенант Н.И. Сорокин. Контейнер, к сожалению, упал в море.
Если подготовка лётчиков-снайперов не представляла особого секрета, не требовала строительства каких- либо сложных аэродромных сооружений, то несколько иные подходы обозначились при подготовке экипажей самолётов-носителей ядерного оружия.
В книге "Морская мощь государства", написанной Научно-техническим комитетом ВМС, есть такие строки "…в начале 1954 г. Советская Армия и Военно-Морской флот располагали ядерным оружием различной мощности, в том числе водородными бомбами, и приступили к практическому изучению этого оружия, способов боевых действий в условиях его применения". Не совсем ясно, что имелось в виду, поскольку создание БР с ядерной БЧ для размещения на ПЛ началось в 1955 г., и только в феврале 1959 г. ракетный комплекс Д-1 с ракетой Р-11ФМ, разработанной на базе армейской Р-11ФМ, поступил на вооружение. Первый пуск БР с ядерным зарядом, обозначенным аббревиатурой "РДС-4", которую иногда расшифровывали – "русские делают сами", был выполнен в 17 ч 32 мин 16 сентября того же года.
