В конце мая гидроавиационный отдел УВФУ располагал воздушной станцией и 1-м Одесским отрядом (начальник — Е.Е. Коведяев), 2-м Севастопольским гидроотрядом (начальник отряда — Н.Л. Михайлов); станциями в Отарике и в Кларовке. Гидроавиационным отделом командовал В.Р. Качинский. Предполагалось открыть авиационную школу в Очакове. Самолётный парк состоял из шести отечественных гидросамолётов в Одессе (исправен один) и четырёх более-менее пригодных к эксплуатации в Севастополе.
В начале июля 1919 г. гидроавиационный отдел УВФУ переименовали в отдел морской авиации. В первых числах июля решили объединить одесские подразделения в 1-й Черноморский гидроотряд (начальник — И.А. Галиченко, в прошлом унтер-офицер), придать отделу авиапарк в Николаеве, переименовав его в Николаевские мастерские морской авиации. В середине июля в Киеве создали 2-й Черноморский гидроотряд (начальник — В.Р. Качинский), который вскоре прикоман-дировали к Днепровской военной флотилии.
В июне — августе 1919 г. в связи с наступлением войск генерала Деникина советская власть на Украине и в Крыму была временно свёрнута. Украинская морская авиация существование прекратила: севастопольский отряд отправили в Херсон; 1-й Черноморский гидроотряд достался белым; 2-й Черноморский гидроотряд в начале августа переименовали в Днепровский. Приказ о его формировании был отдан в Киеве в первых числах июля 1919 г., после чего из Одессы и Севастополя затребовали несколько самолётов. В результате получили две летающие лодки российской постройки, один немецкий гидросамолет «Румплер» и самолёт на колесном шасси, который предполагалось оборудовать поплавками. В полевом управлении 12- й армии, которой подчинялась флотилия, решили, что в гидроотряде необходимости нет, и решили отправить все гидросамолёты в Москву (авиацией и воздухоплаванием 12-й армии руководил военно-морской летчик В.А. Корольков.). Но планы изменили и в начале сентября. Флотилию и отряд перевели в Гомель. Там Днепровский гидроотряд усилили тремя летающими лодками, двумя истребителями, самолётом на колесном шасси и плавбазой «Орлица». В мае 1920 г. подразделения Днепровской флотилии спустились вниз по течению к Черному морю. Отрядом руководили: В.Р. Качинский — в июле 1919 г., А.Е. Жуков — в августе-сентябре 1919 г., Г. Жилинский — зимой 1920 г., В.Н. Филиппов — весной 1920 г., М.А. Коровкин — в октябре 1920 г., Гарусов — в декабре 1920 г.
Белогвардейцы также предпринимали попытку сформировать свою морскую авиацию из разрозненных отрядов на Черном и Азовском морях, на Дону и на Каспии. В конце апреля 1919 г. начальник морского авиаотряда старший лейтенант В.А. Литвинов обращался в британскую военную миссию с просьбой выделить 30 самолётов и приступить к ремонту имеющихся четырех лодок. В это время в Таганроге находился гидроавиационный дивизион Всевеликого войска Донского с двумя летчиками и девятью неисправными летающими лодками, вывезенными из Севастополя в феврале 1919 г. Имелось намерение объединить всю гидроавиацию вооруженных сил Юга России и к маю-июню сформировать два боеготовых гидроотряда. В качестве основной базы предполагался Ейск и воздушный пост в Керчи. В конце мая 1919 г. утвердили штаты Ейского отряда (начальник В.А.Литвинов). К середине сентября 1919 г. белые предполагали закончить формирование трёх гидроотрядов: Севастопольского; Северной части Черного моря и особого назначения для действий на Волге или Каспии.
