Радиус действия комплекса Ту-16К-16 составлял 1900-2000 км, а дальность пуска ракет - 160-170 км. Для того, чтобы обеспечить пуск с этих удалений операция по взятию цели на автосопровождение начиналась за 20-30 км до отцепки. В отличие от существовавших ранее систем цель бралась на автосопровождение аппаратурой, установленной на крылатых ракетах. При этом имелась возможность направить обе ракеты на одну цель или выбирать для каждой из них свою цель. Отцепка крылатых ракет происходила поочередно. После этого через 7 с запускался двигатель и производился разгон. В зависимости от высоты и скорости полета просадка ракеты после отделения от самолета достигала 600-1200 м.
Через 40 с после отцепки механизм времени выдавал команду на подключение автопилота ракеты к РЛС самонаведения КС-11М, а двигатель переводился на маршевый режим. Обычно к этому времени ракета достигала скорости 1250 км/ч. С приближением ракеты к цели на расстояние 15 км станция
К-11М выдавала команду на разориен-тирование гироскопа упреждения и управление ракетой производилось уже с учетом скорости цели. Эта же команда использовалась для разблокирования стопорного устройства антенны и после того как ее оптическая ось совмещалась с продольной осью ракеты вновь стопорилась. В таком режиме станция К-11М работала до конца полета ракеты. Когда расстояние до цели сокращалось до 450 м станция КС-11М выдавала команду на отключение радиоуправления и ракета продолжала полет, сохраняя последнее положение еще в течение 1,2 -1,6 с после чего переходила на пикирование.
К освоению ракетного комплекса Ту-16К-16 морская авиация приступила в феврале 1963 г. Начало ему положили летчики, штурманы и инженерно-технический состав 540-го мрап 33 учебного центра, в следующем году к переучиванию приступил 12-й мрап авиации БФ, в 1965 г. эскадрилья мрап авиации ТОФ, второй полк из состава этого флота осваивал новую систему в 1967 г. Всего в авиации ВМФ на комплекс Ту-16К-16 перешли четыре мрап.
Первые практические пуски ракет производились экипажами 33-го учебного центра в период с 25 октября по 23 ноября 1962 г. С поступлением ракет КСР-2 начались работы и исследования, направленные на снижение высоты пуска. Оказалось, что без особых затруднений и доработок ракету можно применять с высоты 2000 м. такая возможность была обоснована теоретически в 33-м учебном центре и проведены практические пуски в 1964 г.
В 1967 г. в Государственном научно-исследовательстком краснознаменном институте проведены пуски ракет с малых высот. Приказом Министра обороны от 22 апреля 1968 г. была утверждена доработка, которая обеспечивала возможность пусков ракет в расширенном диапазоне высот от 500 до 10000 м. Доработанным ракетам присвоили шифр КСР-2М. Благодаря изменениям в конструкции просадка ракеты после пуска уменьшилась до 150-200 м, через 50 с она выходила на высоту пуска, а еще через 40 -50 с оказывалась выше на 500-800 м. В дальнейшем полет происходил по наклонной прямой к цели в режиме самонаведения по курсу и высоте. Практические полеты позволили установить, что минимальная дальность пуска КСР-2М с высоты 500 м ограничивается радиолокационной видимостью цели и временем, затрачиваемым на подготовку ракеты к пуску. Практически она составляла 70-80 км.
