В ходе производства на самолетах внедряли более современные и надежные модели стрелковых башен FN79, FN121 и FN150. С 1945 г. стали устанавливать английские башни Frazer Nash FN82 либо Rose Rise Mod.2 Mk.I. со спаренными 12,7-мм пулеметами. Последние были более просторными и в отличие от FN82 позволяли стрелку держать парашют при себе, что существенно повышало его шансы выжить в случае сбития самолета.
Самолеты первых серий имели стандартный бомбоотсек длиной 10,13 м и шириной 1,68 м, рассчитанный на 3630 кг бомб (8000 фунтов). Часть «Ланкастеров» получила т. н. «углубленный» бомбоотсек под бомбы Tallboy или Block Buster калибром 12000 фунтов (5448 кг). Створки его люка имели характерную выпуклую форму. На таких самолетах отсутствовали нижние оборонительные установки, а при полетах на большую дальность с них снимали и верхние. В целом, селектор бомбового вооружения и набор бомбодержателей обеспечивали подвеску бомб в различной комбинации, например, четырнадцать 454-кг бомб или шесть 908-кг и три 114-кг. «Ланкастеры» Mk.II отличались удлиненным бомбоотсеком, рассчитанным на 6351 кг (14000 фунтов) боевой нагрузки.
Уже упоминаемый радар H2S вошел в стандартный состав оборудования «Ланкастера» с 1943 г. Его антенну монтировали под хвостовой частью фюзеляжа и закрывали плексигласовым обтекателем. РЛС позволяла обнаруживать радиоконтрастные наземные цели. Ее экран находился на рабочем месте оператора. Часть самолетов оснащали также радионавигационной аппаратурой Gee, Oboe и Rebecca. В 1943 г. на самолеты стали устанавливать РЛС защиты хвоста Monika, сканировавшую воздушное пространство в секторе 45° и дававшую возможность обнаружить приближавшиеся истребители противника. Но вскоре на немецких ночных истребителях появилось оборудование, позволявшее наводить их по излучению «Моники», и от использования таких радаров британцам пришлось отказаться.
Кроме основных вариантов «Ланкастера», существовал еще немалый ряд модификаций, которые в том или ином количестве строили серийно или получили путем переоборудования. Так, в начале 1945 г. 33 машины Mk.I переделали в самолеты Mk.I (Special), приспособив их для подвески бомбы Grand Slam, которая весила без малого 10 т (точнее, 9979 кг — 22000 фунтов). Для экономии веса с машин сняли носовую и верхнюю стрелковые установки, в хвостовой оставили лишь два пулемета, а также демонтировали створки бомбоотсека. Сам же бомбоотсек удлинили, а шасси самолета усилили. Вариант Mk.I(FE)
