На ранних этапах разработки эскизного проекта пусковой установки исследовались различные варианты газоотбойных и газоотражательных конструкций, предотвращающих эрозию грунта площадки при старте ракеты. Резинометаллические "ковры" были отвергнуты практически сразу. Для экспериментальных исследований на ленинградском заводе "Арсенал" был изготовлен газоотражатель рассекающего типа. Он был доставлен для испытаний на полигон Ржевка, но на пусковую установку так и не монтировался. Использование на ракете стартовых ускорителей с развернутыми наружу соплами явно сводило его эффективность практически к нулю.
Общая конструктивная схема напоминала пусковую установку СМ-63 комплекса С-75. Основными внешними отличиями были два мощных гидравлических цилиндра, примененные вместо использовавшегося в С-75 секторного механизма подъема стрелы с направляющими, отсутствие газоотражателя, а также подводимая к нижней поверхности передней части ракеты откидная рама с электровоздухоразъемами.
В ходе испытаний первого этапа, проводившихся на Ржевском полигоне с использованием так называемых ИРС — имитаторов ракет, было проведено окончательное согласование пусковой установки, ракеты, заряжающих машин и вспомогательного оборудования, определены реальные нагрузки, возникающие при старте ракеты.
В дальнейшем, исходя из результатов испытаний на полигоне Ржевка, в 1961 — 196.3 it. была выпущена опытная партия пусковых установок СМ-99А для проведения заводских и совместных испытаний в составе полигонного варианта системы С-200 па Балхаше. В свою очередь, технический проект серийной пусковой установки 5П72 был выполнен на базе СМ-99А позднее, в 1962 г.
А еще в 1960 г. по результатам проработки нескольких вариантов заряжающей машины был выпущен рабочий проект ее опытного образца с использованием компоновочной и кинематической схем, предложенных С.П. Ковалесом. Разработка проекта заряжающей машины велась под руководством А.И.Усгименко и А.Ф.Уткина. Опытная партия заряжающих машин для проведения заводских и совместных испытаний была изготовлена на Московском заводе "Машиностроитель" в период 1961–1962 гг. Рабочий проект серийного варианта машины появился в 1962 г.
Параллельно с проведением работ по проектированию и изготовлению новой зенитной ракетной системы велась подготовка к ее отработке и полномасштабным испытаниям, Расположенный в Казахстане, к западу от озера Балхаш, полигон "А" Министерства обороны следовало подготовить к приему и хранению новой техники. Для проведения испытаний уже в августе 1960 г, требовалось построить позицию радиотехнических средств и стартовую позицию в районе площадки "35" полигона. Ленинградский филиал ЦПИ-20 МО должен был провести проектирование полигонных позиций системы С-200.
