И с этих дней Соловки стало не узнать. С приходом Филиппа на пост настоятеля монастыря, государь московский Иван Васильевич стал проявлять к обители неслыханное доселе внимание и всячески способствовал его экономическому развитию. Отменялись пошлины на соль, которую варили монахи в особых варницах, на полученные прибыли Филипп был волен сам, не спрашивая разрешения ни у кого, приобретать необходимые, на его взгляд, товары. На берегах Белого моря поначалу стали появляться новые варницы, приносящие пока основную часть дохода обители. По всему видно, что Иван Грозный стремился избежать прямого финансирования далекого монастыря, чтобы лишний раз не привлекать внимание, не будоражить интерес к северным алмазоносным островам.
Монастырь продолжал строить свою обособленную экономику, приносящую по тем временам богатые доходы. Помимо соли, производство которой росло год от года (благо условия, предоставленные Москвой, способствовали), начался планомерный экспорт леса, причем вырубки были организованы с расчетом на воспроизводство лесных ресурсов. Филипп вкладывал деньги в то, что сегодня принято называть модным иностранным словом «инфраструктура». За невиданно короткие сроки в глубине большого Соловецкого острова вырос кирпичный завод, который был призван обеспечить планируемое строительство, выкопан огромный котлован Святого озера, куда протянули километры каналов, закованных в валунные набережные. Они забирали тонны воды из разбросанных по всему острову озер и приносили их под стены монастыря. Зачем? Принято говорить, что это было фортификационное сооружение, что, дескать, с востока это озеро было необходимо в качестве рва перед монастырскими стенами. Странно. Почему бы тогда и в самом деле не выкопать ров? К чему те неимоверные усилия, которые были в буквальном смысле закопаны в землю при строительстве озера и системы каналов?
Одним из первых зданий, сооруженных при Филиппе на пепелище монастыря (он опять горел в 1438 году), была деревянная мельница. На том же месте, где сегодня стоит необыкновенный каменный дом, изгибающийся углом и прижимающийся двумя ярусами каменной галереи с колоннадой — тоже мельница, только более поздней постройки. Мельница была водяная. Только канала к ней никто никогда не видел. Потому что он был проложен целиком под землей от дна искусственного Святого озера с большим изгибом к самой мельнице и дальше, к морю. К чему такая сложность конструкции и такая секретность? Ведь, по сути, получается, что огромное Святое озеро — всего лишь водохранилище, обеспечивающее бесперебойную работу мельницы в течение года. Под землей, на глубине, где была проложена труба к первому ярусу подземелий мельницы, вода не замерзала зимой и поступала из-под толстого льда Святого озера.
