Сам он был москвич, имел прусское происхождение. Дед его отличился и прославился во времена Ивана III, за что был пожалован землями. Был он и воеводой Господина Великого Новгорода, и послом в Крымской орде. Наверное, много чего узнал от новгородцев за несколько лет, проведенных в городе. Мать Федора Степановича Колычева имела огромные владения под Новгородом. В общем, видимо, неспроста постригшийся в монахи молодой боярин выбрал местом своего духовного уединения отдаленный Соловецкий монастырь. Причем ушел в монахи он как-то спонтанно, словно совсем не боясь оставить привычную комфортную жизнь столичного боярина ради северной глуши и тягостного труда. Может быть, сам царь повелел ему блюсти этот необычный монастырь, скрытые богатства которого так необходимы были казне?
Впрочем, Филипп (под этим именем постригся Федор Колычев) отнюдь не сразу стал настоятелем. Целый год был он тружеником еще до пострига. Известно, что Филипп попал в обитель инкогнито, не предупредив никого о своем знатном происхождении, видимо, чтобы не вызывать подозрений со стороны братии и не привлекать внимания общественности. На время он как бы выпал из жизни страны. Лишь царю и немногим его приближенным было известно, где находился Федор. Интересно также, что за некоторое время до того как молодой Колычев отправился на Соловки, в один из отдаленных северных монастырей отправилась (может быть, не по своей воле?) мать Федора. Ведь какое опасное и важное задание намеревался дать царь ее сыну! Вряд ли это понравилось бы богатой и известной боярыне.
Филипп тем временем усердно молился в стенах соловецких храмов. Он настолько полностью погрузился в монашескую жизнь, что его духовные подвиги вызывали у всех прочих монахов уважение. Несколько лет он даже провел в абсолютном уединении. Такое усердие молодого инока удивляло всех. Уже через девять лет (рекордно короткий срок для монашеской карьеры) ему было предложено стать игуменом. Поначалу он отказывался, но это только подвигло всю братию на единогласное избрание его настоятелем. Еще Борис Годунов понял, что для того чтобы вызвать к себе абсолютное доверие, можно, будучи уверенным в своей неоспоримости, поначалу и отказаться от царства. А взять бразды правления в свои руки — только когда уже сам народ придет и начнет умолять. На второй раз и Филипп согласился возглавить обитель. Это был год 1548-й. Прежний игумен сам передал бразды правления Филиппу. Ровно через десять лет по западной границе Руси прокатится первое наступление Ливонской войны.
