Конструктивно это трёхдвигательный низкоплан с высоко расположенным Т-образным хвостовым оперением и лыжно-амортизирующим устройством (ЛАУ) в нижней части фюзеляжа, предназначенным для обеспечения разбега (посадки) при волнении и движения в амфибийном режиме. Загрузка и разгрузка грузового отсека (до 20 т) производится через люк, образующийся при повороте влево носовой части фюзеляжа с двигателями и кабиной лётчиков. В фюзеляже размещались помещения для отдыха, радиоэлектронное и радиосвязное оборудование, вспомогательные силовые установки (ВСУ) ТА-6.
Крыло, оптимизированное для движения вблизи экрана, состояло из центроплана и двух консолей, на концах которых установлены поплавки. Задняя кромка крыла снабжена пятисекционными закрылками-элеронами с несколько необычным диапазоном углов отклонений (от -10 до + 42 град), передняя кромка крыла оснащена специальными стартовыми щитками. При запущенных стартовых двигателях и отклонении закрылков и щитков, направляемая под крыло (задняя кромка его на плаву находилась в воде) струя поднимала экраноплан.
Хвостовое оперение с тем, чтобы повысить устойчивость движения имеет относительно большую площадь. Киль вертикального оперения выполнен заодно с фюзеляжем. В его верхней части установлен маршевый двигатель, навигационные огни и антенны радиотехнических систем.
Перемещение рулевых поверхностей экраноплана, а также уборка и выпуск шасси, ЛАУ, механизации крыла, отклонение носовой части фюзеляжа обеспечивает гидравлическая система. Для улучшения характеристик устойчивости на основных режимах движения на борту установлена система управления движением.
Шасси экраноплана состоит из двухколёсной поворотной передней опоры и основной опоры из десяти колёс. Колёса главной опоры втягиваются в фюзеляж, а передние заваливаются за главную гидролыжу, которая в убранном положении частично их прикрывает.
Силовая установка экраноплана проекта 904 состоит из двух носовых двухконтурных двигателей НК-8-К (устанавливаются на самолётах Ил-62) и кормового маршевого двигателя НК-12МК (входит в состав силовых установок Ту-95 и Ту-142).
Двигатели являются морскими модификациями. Носовые двигатели (тяга по 10 500 кг) снабжены поворотными насадками, чтобы направить реактивную струю под крыло (режим наддува) или над крылом на крейсерском режиме для создания дополнительной тяги. На разбеге в режиме поддува под крыло носовые двигатели снижают гидродинамические нагрузки, особенно при взлёте с неспокойной водной поверхности.
