2 марта 1798 г. Великому Магистру фон Гомпешу донесли, что перед Мальтой выстроились в линию 18 военных фрегатов, под французскими флагами. Вскоре на лодке прибыл офицер, который сообщил, что этими судами командует адмирал Брюйес, вышедший недавно из Корфу. Адмирал не просил, а требовал разрешения войти в порты, под предлогом починки некоторых судов и пополнения запасов свежей водой.
Гомпеш тут же распорядился собрать Государственную Конгрегацию, учрежденную еще Великим Магистром де Роганом вскоре после происшедшей во Франции революции. На Конгрегацию были возложены обязанности следить за безопасностью Мальты, ей были так же даны весьма широкие полномочия «предупреждать и отвращать угрожавшие оному бедствия и избирать нужные против того средства по обстоятельствам»[44].
Когда собравшимся рыцарям были переданы требования французского адмирала, члены Конгрегации приняли единственно верное решение: строго придерживаться нейтралитета.
Тогда же Великий Магистр «принял все меры предосторожности, в случае если бы французский флот захотел войти силой»[45]. В порты, расположенные на восточном и западном берегу острова, была послана дополнительная артиллерия и необходимые воинские силы.
Великий Магистр объявил решение Конгрегации Брюйесу, дополнив его, что, по существующим у ордена правилам, в порт Мальты могут войти одновременно не более 4 кораблей. Одновременно Гомпеш отправил в порты Марса-Сироко и Святого Павла, расположенные один на восточном, а другой на западном берегу острова, войска с артиллерией. В порту Марса-Мушьетто и в главном мальтийском порту было все подготовлено для отражения возможной атаки и сожжения неприятельского флота, если Брюйес попытается туда войти.
Эти приготовления не остались тайной для французского адмирала, тем более что все передвижения на острове хорошо просматривались с французских судов. Адмирал Брюйес вынужден был ограничиться отправлением в мальтийский порт только одного корабля с шебекою[46]. На другой день французская флотилия отошла от порта на значительное расстояние, но еще девять дней оставалась в виду острова, крейсировала вокруг Мальты. Этот осмотр был предпринят, вероятно, с единственной целью — поиск удобных мест к предстоящей высадке войск.
А тем временем прибывший на корабле некий французский коммерческий агент Карюзон, назначенный Комитетом общественного благосостояния в качестве консула на Мальту, а по сути являвшийся французским шпионом, постоянно разъезжал из Мальты во флот и обратно. Более того, Гомпешу доложили, что Карюзон имеет «тайные сношения с единомышленниками на острове. Примечены даже некоторые сигналы, которые он подавал им при приближении своем к берегам»
