Ставка оккупантов на паназиатский шовинизм скоро оказалась битой. Безудержное ограбление страны, жестокости военщины и кэмпейтай, политика принудительной японизации — все это восстановило против японцев практически все классы индонезийского общества. В городе Понтианаке (Западный Калимантан) был раскрыт антияпонский заговор, руководимый местной аристократией. Крестьяне Явы оказывали сопротивление реквизициям, укрывались от насильственной мобилизации. В июле 1942 г. на Восточной Суматре под руководством деятелей Гериндо развернулось крестьянское восстание. Доведенные до крайности рабочие совершали акты саботажа, портили оборудование, В начале 1943 г. кэмпейтай раскрыла в Сурабае боевую подпольную организацию Гераф (Народное антифашистское движение) под руководством коммуниста Амира Шари- фуддина. 55 человек были казнены[20].
Неудачи фашистского блока на фронтах заставили оккупантов пересмотреть тактику; они пытались опереться на авторитетных лидеров национального движения, и прежде всего на освобожденных Сукарно и Хатту. Последние, поддерживая связь с антияпонским подпольем, в свою очередь рассчитывали использовать предоставленную им общественную трибуну для пропаганды идей национального сплочения и независимости. Так, в 1943 г. японцы основали общественно–политическую организацию Путера (Центр народных сил) во главе с Сукарно, Хаттой, Мае Мансуром (лидером МИЛИ) и Ки Хаджар Деванторо.
В феврале 1944 г. оккупанты преобразовали Путера в Союз верности народу Явы во главе с теми же лидерами, но с меньшим представительством радикальных националистов, так как, вопреки их расчетам, эта организация стала проявлять излишнюю самостоятельность. Опасаясь вспышки возмущения набожных мусульман (сантри), которая могла принять форму джихада (священной войны), японцы осенью 1943 г. разрешили создать на базе МИАИ еще более широкую федерацию Машуми (Консультативный конгресс индонезийских мусульман) также с неполитическими функциями.
Осенью 1944 г. американцы в ходе вторжения на Филиппины захватили Биак, Моротаи и другие восточные острова Индонезии. Голландское радио возвестило из Австралии о создании там голландской Гражданской администрации Нидерландской Индии (НИКА), готовящейся к восстановлению колониального режима. Учитывая сложившуюся ситуацию, в сентябре 1944 г. японский премьер Койсо обещал Индонезии независимость, в будущем (имелось в виду лето 1946 г.). Отныне было позволено вывешивать национальный красно–белый флаг, исполнять гимн «Великая Индонезия». Машуми получила разрешение формировать военизированные отряды Хизбуллах.
