С 1 сентября 1969 г., после расформирования эскадрильи транспортных самолетов, часть именовалась 960-м учебным авиационным полком. В период с 1969 по 1978 гг в Приморско-Ахтарске эксплуатировали самолеты Л-29. Им на смену пришли Л-39 «Альбатрос», количество которых к началу 90-х было доведено до шести эскадрилий.
После распада Советского Союза одной из приоритетных задач формируемых ВВС России стало прикрытие воздушного пространства на ключевых направлениях изменившейся государственной границы. Для этой цели многие авиаполки меняли места своей постоянной дислокации, получали новую авиационную технику или меняли свое назначение. Не стал исключением и 960 УАП. 3 февраля 1993 г. он был переформирован в истребительный: вместо учебных Л-39 на вооружение поступили фронтовые истребители МиГ-29. Тогда же 960 ИАП вывели из подчинения Краснодарскому ОВЛТУ и передали в распоряжение 16-й гвардейской истребительной авиадивизии 4-й Воздушной Армии.
Переформирование полка из учебного в истребительный повлекло за собой частичную ротацию летного и инженерно-технического персонала. В Приморско-Ахтарск прибыли офицеры из других частей, эксплуатировавших МиГ-29, а местные летчики приступили к теоретическому и практическому переучиванию на новую авиационную технику. 1-я эскадрилья состояла из летчиков, прибывших из Западной группы войск, 2-я — из летчиков-инструкторов бывшего учебного полка, 3-я — из летчиков, выведенного из Грузии и расформированного 176 ИАП.
Поскольку закупка новых истребителей МиГ-29 для нужд ВВС России была уже свернута, оснащение полка велось в основном за счет «излишков», образовавшихся в результате вывода авиационных полков из ЗГВ, и из техники, возвращаемой после капитального ремонта с АРЗ. Первый МиГ-29УБ встретили на аэродроме в январе 1993 г., полностью же перевооружение на МиГ-29 завершилось в 1995 г. С 1 марта 1995 г. личный состав полка приступил к несению боевого дежурства в системе ПВО.
Вскоре после переформирования на многих самолетах 960 ИАП появились дополнительные опознавательные элементы — внешние стороны рулей направления выкрасили в цвета российского триколора. Затем в Приморско-Ахтарске приняли решение придумать свою эмблему. Сейчас сложно комментировать, чем руководствовались полковые художники и думали ли они в тот момент о соблюдении «авторских прав», но утвержденный и нанесенный на «миги» с бортовыми номерами 30, 32, 34 и 89 рисунок практически один в один повторял эмблему пилотажной группы «Стрижи». Различие было минимальным и заключалось только в том, что надпись «Кубинка» внутри нижней ленты ахтарцы заменили на «МиГ-29». Но эта эмблема — не единственное, что связывало ахтарский полк со «Стрижами»: в 90-х в нем проходили службу Дмитрий Копосов и Игорь Соколов, со временем ставшие одними из ведущих летчиков АГВП «Стрижи».
