За счет доработки антенной системы увеличили дальность и потолок обнаружения воздушных целей. Последнее было достигнуто за счет введения в тракт приемных устройств полестированной лампы бегущей волны с высокой чувствительностью (изготовитель — НИИ «Исток»).
В комплексе П-80А были введены режимы работы НЛЦ (т. е. работы по низколетящим целям) и ВЛЦ (по высоколетящим целям). Усовершенствовали конструкции прицепов, улучшили эксплуатационные характеристики.
Если первые модификации РЛК П-80 («Алтай») могли обнаруживать самолет типа истребителя МиГ-17 на наклонных дальностях до 250–300 км, а максимальная высота (потолок) по тому же типу самолета составляла 34 км, то у варианта 1РЛ118МЗ дальность обнаружения составляла 300–350 км, а потолок — 45 км.
Проводились работы по сопряжению РЛК с наземными запросчиками. Наземный радиозапросчик «Тантал» изготовления Муромского радиозавода заменили на радиозапросчик «Квант» разработки Новосибирского НИИ-208, с дистанционным переключением кодов (для систем опознавания «Кремний-2» и «Кремний-2М»).
РЛК П-80А (1РЛ118МЗ) предназначался как для автономной работы, так и для работы в составе автоматизированных систем «Воздух- 1П», «Воздух-1M», АСУРК-1М, «Луч-1», а также в стационарных системах управления С-25 и С-100. Комплекс П-80А выпускался в Правдинске крупной серией в течение 1966–1972 гг.
В 1967 г. был создан вариант размещения РЛК 1РЛ118МЗ в системе «Линия». В ноябре 1966-го — апреле 1967 г. комплекс 1РЛ118МЗ прошел ходовые испытания, успешно преодолев 3000 км по степям Астраханской области и сохранив работоспособность. От заводского ОКБ в испытаниях участвовали конструкторы Д.А. Попова (Балькина) и P.P. Ефимычева.
Следующая модернизация, осуществленная в рамках опытно-конструкторской работы по теме «Кабина-66», привела в начале 1970-х гг. к созданию фактически нового комплекса — 5Н87, достойного отдельного описания. В этом комплексе впервые в мире реализовали автокомпенсаторы для защиты от активных помех.
РЛК П-80 («Алтай») несли службу по всей территории Советского Союза в боевом режиме и часто — в тяжелых ветровых и атмосферных условиях. Еще 20 апреля 1962 г, Комиссией Президиума Совета Министров СССР по военно-промышленным вопросам было принято решение об упорядочении проектных и опытных работ по созданию радиопрозрачных укрытий для наземных радиолокационных станций. Для РЛК «Алтай» НИИ-244 (ЯРТИ) совместно с НИИ резиновой промышленности, 31-м Центральным проектным институтом специального строительства МО СССР, проектно-конструкторским бюро № 12 (впоследствии — «Проектмонтажавтоматика») и проектным институтом «Промстальконструкция» разработал радиопрозрачное укрытие «Шалаш-А», принятое в 1969 г. к производству под обозначением 5У91 и выпущенное ограниченной партией Балахнинским электромеханическим заводом.
