О трагедии немедленно доложили лично Хрущеву:
«Москва. Кремль. Первому секретарю ЦК КПСС Н. С. Хрущеву.
В 18:45 по местному времени, за 30 минут до пуска изделия, на заключительной операции произошел пожар, вызвавший разрушение баков с компонентами топлива. В результате случившегося имеются жертвы в количестве до ста или более человек. В том числе со смертельным исходом несколько десятков человек. Глав, маршал артиллерии Неделин находился на площадке для испытаний. Сейчас его разыскивают. Прошу срочной мед. помощи пострадавшим от ожогов огнем и азотной кислотой.
Янгель, аппарат Неделина».
25 ноября на Байконур вылетела комиссия ЦК КПСС во главе с Брежневым. В нее вошли крупные специалисты по ракетной технике, руководители Министерства обороны и промышленности. На следующий день Брежнев собрал совещание, на котором объявил, что вероятные виновники трагедии погибли, и всем нужно сделать из произошедшего соответствующие выводы, а наказывать никого не будут. Такое неожиданное для Янгеля решение возникло только из-за воистину провального положения в советском ракетостроении, ведь боевых межконтинентальных ракет у СССР фактически не было. А американцы со своим «Титаном» уже вырвались вперед. Наказанием Янгеля и других высокопоставленных участников трагедии, Брежнев мог только навредить, отбросив ракетную науку на 4-5 лет назад. Азотнокислотное направление было бы окончательно дискредитировано на долгие годы, что может и к лучшему, а на вооружение (в виду полного отсутствия научного задела в твердотопливном направлении) пришлось бы брать большое количество не менее опасных королевских ракет Р-9.
Причина и подробности катастрофы до 1995 г. были засекречены. 27 ноября 1960 г. в газетах появилось небольшое сообщение о гибели маршала Неделина в авиакатастрофе. Родственникам остальных погибших рассказывали легенду о внезапном взрыве бензовоза.
После трагедии второй экземпляр Р-16, находившийся в монтажно-испытательном корпусе, был отправлен на завод для устранения всех недостатков и внесения изменений в схемы управления пуском.
Менее чем через месяц доработанную ракету повезли обратно на полигон. 1 января 1961 г. состав с ракетой и бригадой испытателей прибыл обратно на Байконур.
На этот раз к подготовительным операциям относились с повышенным вниманием и осторожностью. Запуск наметили на 18:00 2 февраля. Несмотря на сильный мороз, ракету установили на стартовый стол. После заправки и проверки обнаружилось, что на ракете не работает система передачи телеметрической информации, но Янгель принял решение продолжать подготовку ракеты. Старт перенесли на полночь.
