1956. В феврале зам. ком. АП по летной подготовке гв. п/п-к Багин и ком. 3-й АЭ гв. м-р Заббаров были откомандированы в Саратов, на авиазавод № 292 для переучивания на новый реактивный самолет-разведчик Як-25Р. В тот момент разведчики на базе Як-25 все еще не вышли из заводских цехов, и для освоения новой техники использовали истребитель Як-25М. Приступив на заводском аэродроме Разбойщина к полетам на Яке, они вскоре вылетели самостоятельно. 29 марта при совместном тренировочном полете на Як-25М загорелся один двигатель, а второй — остановился. Экипаж пытался спасти самолет, посадив его «на брюхо» в поле… Все закончилось катастрофой, полк потерял двух опытнейших летчиков.
С 18 июня в течение месяца полк всем составом базировался на грунтовом аэр. Крючково в р-не Вышнего Волочка, где осваивал полеты на реактивных самолетах с грунта.
1957. Директивой ГШ ВВС от 2 января 1957 г. 3-й АЭ предписывалось в феврале приступить к переучиванию на новые разведчики Як-25Р. Из-за гибели на Як-25М двух летчиков отношение личного состава к новому самолету было довольно настороженным. Начальник разведывательной и специальной авиации ВВС генерал Заяц прибыл в полк и, встретившись с летным составом 3-й АЭ, провел разъяснительную беседу, а командованию полка и эскадрильи дал конкретные указания о порядке переучивания. Для оказания помощи в переучивании на Як-25 ГШ ВВС выделил из ГК НИИ ВВС ведущего инженера-испытателя Як-25М Ольгу Ямщикову и летчика-испытателя Б. Андрианова.
В феврале началось теоретическое переучивание, 10 февраля в Мигалово появился первый учебный Як-25М, а 20 февраля командир АЭ гв. м-р Лихачев со штурманом АЭ Махновым уже приступили к тренировочным полетам. 17 мая 1957 г. летчики-испытатели МАП Афанасьев и Каширин и штурманы 3-й АЭ Махнов и Баталов перегнали из Саратова в Мигалово два первых Як-25Р, а к 21 июня в полку было уже пять новых самолетов-разведчиков и один учебный Як-25М. Поскольку разведчик к тому времени не прошел полностью госиспытания и не был принят на вооружение, экипажи эскадрильи приступили к полетам на Як-25Р лишь в августе. Уже в конце сентября весь летный состав эскадрильи летал на новом разведчике самостоятельно, а командир АЭ приступил к отработке боевого применения днем в СМУ.
К концу года полк располагал 20 Ил-28Р и 2 учебнобоевыми УИл-28, на которых было подготовлено 30 экипажей, а на Як-25Р приходилось 8 боеготовых экипажей.
1958. Основными задачами этого года были:
