За весь период применения МиГ-25 в Египте сбить его «Фантомам» так и не удалось. Личный состав IDF/AF, привыкший к работе на средних и малых высотах, не имел необходимых для высотного перехвата навыков и оказался не готов к выполнению такой задачи.
18 сентября 1971 г. израильтяне нанесли удар по позициям египетской ПВО. В ходе этого налета «Фантомы» впервые на Ближнем Востоке применили противорадиолокационные ракеты AGM-45 Shrike, но результаты 12 пусков разочаровали командование. Одна ракета упала рядом с кабиной РЛС П-35, не причинив ей никакого вреда, на нескольких ракетах не сработали взрыватели, остальные просто не попали в цели.
В 1971 г. израильтяне активизировали воздушную разведку. К выполнению этой задачи сначала привлекли полученные из США во временную эксплуатацию два RF-4C. В начале лета их сменили 6 заказанных ранее RF-4E. В октябре в одном из вылетов RF-4E подвергся обстрелу ПЗРК «Стрела-2». Экипажу повезло, слабенькая боевая часть ракеты не причинила «Фантому» особого вреда, и он вернулся на свой аэродром. Летом 1972 г. RF-4E произвели несколько успешных боевых вылетов над Сирией. Все попытки сирийских ЗРК и «МиГов» сбить разведчики окончились неудачей.
Осенью 1972 г. в ответ на убийство израильских спортсменов на олимпиаде в Мюнхене «Фантомы» провели целую серию ударов по лагерям Организации освобождения Палестины в Сирии и Ливане. Во время этих налетов был потерян один F-4E, но сбить удалось два МиГ-21.
21 февраля 1973 г. пара F-4E сбила пассажирский Boeing 727 ливийской авиакомпании. Погибли 216 пассажиров.
Судный день
6 октября 1973 г. египетские и сирийские войска начали широкомасштабное наступление против израильских позиций на Синайском полуострове и Голанских высотах. Его поддерживали крупные силы авиации, которые по численности превосходили IDF/AF почти в два раза.
Египетская авиация начала войну с удара по израильским аэродромам Рафидим и Офир, ЗРК, пунктам управления и РЛС на Синае. «Фантомы» вступили в бой немедленно. Дежурная пара F-4E взлетела с Рафидима, когда над ним уже находилось около двух десятков МиГ-17. В результате боя ей удалось сбить 7 самолетов. Египтяне не признали сам факт этого боя, хотя потерю 7 самолетов в тот день не отрицают. В это время другие «Фантомы» наносили бомбовые удары по наступавшим войскам и потеряли от огня сирийского ЗРК один F-4.
В конце дня египетский спецназ приступил к операциям в глубине обороны израильтян. Группы диверсантов доставляли вертолеты Ми-6 и Ми-8. Дежурная пара F-4E из 119-й эскадрильи была вызвана в район Рас-Судр, где наблюдатели обнаружили большое число вертолетов противника. Прибыв на место, летчики встретили около двух десятков винтокрылых машин, часть из которых уже приземлилась и начала высадку. Используя ракеты AIM-9 и пушки, летчики уничтожили пять Ми-8. Еще один вертолет попал в спутную струю от «Фантома» и разбился. По египетской версии, ничего подобного, конечно, не было и быть не могло. Их данные говорят о потере пяти вертолетов, но в разных частях фронта.
