В октябре и ноябре Козаков совершил еще 10 боевых полетов. Противнике в воздухе почти не было. В ноябре ему присвоили чин полковника и назначили временно командиром 7-го авиадивизиона. Военно-революционный комитет отдал приказ о прекращении всяких полетов на фронте. Война в воздухе завершилась… Свой последний боевой полет Первой мировой войне Козаков совершил 20 ноября 1917 г.
Полковник решительно отказывается от дальнейшего командования дивизионом и просит о скорейшей замене. Он возвращается в свою авиагруппу. К этому времени е армии приказом отменяются офицерские звания и боевые награды. Теперь Козаков уже не полковник, а гражданин, но еще командир группы. 9 декабря на общем собрании солдат новым командиром 1-й БАГ был избран бывший унтер-офицер И.Павлов. 12 декабря Козаков сдал ему командование группой. Солдаты 19-го отряда не дали в обиду своего бывшего начальника и единогласно избрали теперь уже товарища Козакова своим командиром. Однако позорный финал войны, хаос и развал русского фронта, длительная боевая работа без перерывов и неизвестность будущего подорвали здоровье и дух выдающегося летчика. Он убывает в Киев для лечения.
Новая власть пыталась привлечь Козакова к работе по созданию Рабоче- Кресгьянского Красного Воздушного флота. Но он избрал другой путь. В июне 191В г., когда Мурманск захватили бывшие союзники России, туда устремились многие русские офицеры. 34 русских летчика вошли в состав сформированного 1-ГО Славяно-Британского авиаотряда (1st Slavo-Brltlsh Squadron). 19 июля Козакову присвоили звание майора Королевских воздушных сил (RAF), он стал командиром этого отряда. 7 декабря 1918 г.. вылетев на "Сопвиче-полутораплане" вместе с наблюдателем Норманом Шрайвом на разведку позиций большевиков, Александр был ранен в легкое и не летал уже до конца февраля. Почти год Козаков командовал отрядом так же блестяще, как раньше 19-ым и 1-м БАГ. В июле 1919 г. английские войска стали эвакуироваться из Мурманска. Славяно-Британский отряд прекратил свое существование. Козакову предложили служить в Англии, но получили отказ. Он был мрачен.
Вечером 21 июля русский ас поднял свой "Сопвич Кэмел" с аэродрома Березники. Козаков не сделал никакой попытки набрать высоту и долгое время летел на 5-10 м. Потом он резко взмыл вверх – как будто для мертвой петли. Самолет достиг высшей точки, потерял скорость и вертикально упал вниз. Прежде чем подоспела помощь, летчик скончался.
