Моряки ОВРа не только ставили мины. Перед ними была поставлена новая задача — уничтожать пригоняемые волнами с Балтики плавающие мины. Во время довольно частых штормов мины, поставленные в горле Финского залива немецкими, финскими и советскими кораблями, нередко срывались с якорей и, дрейфуя в заливе по воле ветра и течений, создавали угрозу кораблям, стоящим в порту. Как правило, после каждого шторма одна-две дрейфующие мины появлялись в районе ханковского рейда. Они создавали серьезную угрозу кораблям, стоящим на рейде и в порту. За прилегающим к острову Густавсверн водным пространством велось тщательное наблюдение. Такое же наблюдение осуществлялось и с других наблюдательных постов ОВРа. Для уничтожения обнаруженных мин была создана особая подрывная команда. Возглавлял ее старшина Андреев. На рейдовом катере КМ, таща на буксире шлюпку, подрывники выходили на выполнение боевого задания. Чтобы уничтожить мину, необходимо расстрелять ее из пушки. Пулемет и винтовка для этого дела не годятся. Сквозь пулевые отверстия вода может попасть в корпус мины, и тогда она, приобретая нулевую плавучесть, будет скрытно держаться под поверхностью моря и создавать еще большую угрозу для судоходства. Пушек на «каэмках» не было. Поэтому оставался только один способ: подойти на шлюпке к плавающей мине, повесить на ее рожки подрывной патрон, затем зажечь бикфордов шнур запала и как можно быстрее отгрести на безопасное расстояние.
Контрольное траление фарватеров вели катера КМ. Однако их ограниченные мореходные качества позволяли вести борьбу с минами только на фарватерах, находившихся внутри шхерного района. Но поскольку других плавсредств не было, то «каэмки» отваживались тралить также и выходные фарватеры вне шхерного района.
Вследствие точного знания противником основных фарватеров и навигационных знаков в районе Ханко и в целях затруднения возможных его действий, все навигационные знаки мирного времени были разрушены, маяки потушены, а на фарватерах выставлены минные заграждения.
В связи с этим гидроотделению базы была поставлена задача прокладки новых фарватеров и обеспечения их надежным ограждением для плавания своих кораблей как днем, так и ночью.
Для ночного плавания в закрытой зоне базы Ханко были оборудованы манипуляторные пункты на островах Стура-Стеншер и Линдшер, а у 5-метровой банки Сытина был установлен буек с огнем, который ограждал банку и юго-западную кромку минного поля.
