Отсюда вытекали конкретные задачи:
1. Охрана и изучение охотничье-промысловых животных...
2. Общее изучение природы заповедника как среды, в которой обитают эти промысловые животные.
3. Охрана и изучение растительного покрова Алтайских гор, в частности, исследование растительности заповедника в целях использования ее в народном хозяйстве и в качестве кормовой базы.
Алтайский заповедник развернул широкую деятельность по изучению природы бассейна озера. Главной базой управления был выбран небольшой поселок Яйлю.
Здесь в короткое время были построены жилые дома, здание управления заповедника с хорошими кабинетами, библиотекой, музеем. В поселке расположилась метеостанция и водомерный пост. Был создан научный отдел, который стал проводить стационарные исследования. Научная работа в заповеднике началась с 1934 года.
С открытием заповедника на Телецкое озеро буквально хлынул поток людей, желающих работать в такой интересной организации. И тихая спокойная жизнь на озере заметно оживилась. В охрану заповедника принимали таежников, знатоков дикой природы, которые практически были всегда правой рукой научного отдела.
Многие наблюдатели своими знаниями растительного и животного мира оказали огромную помощь в сборе информации и создании научных трудов. Особенно следует упомянуть наблюдателей: Д.М. Молокова, лучшего знатока Горного Алтая и Западного Саяна, Деменева И.Ф., большого знатока лекарственных растений и методов их применения в народной медицине. Кроме этого, И.Ф. Деменев был непревзойденный охотник-капканщик.
Выделялись своими знаниями природы наблюдатели Ф.И. Табакаев, С.К. Кебезеков, Г.Н. Андадиков, А.И. Кулебакин, Е.Г. Шеинов, Собьяш Казандыков, Василий П, Пыжанкин, П.Ф. Унучаков, М.И. Анферов и др. Они составили костяк охраны заповедника.
Для организации подсобного хозяйства были приняты на работу опытные крестьяне в основном из староверов. Особенно выделились М.О. Ощепков, И.С. Брыляков, П.Ф. Казанин (близкий родственник Лыковых, проживающих в верховьях Б. Абакана). Именно они в первые послевоенные годы добились урожая пшеницы до 45-47 центнеров с гектара. Этот факт был официально зарегистрирован.
В числе первых научных сотрудников, занимающихся исследованием флоры и фауны заповедника, были М.В. Золотовский, М.С. Хомутова, А.Н. Гончарова.
Орнитологи С.С. Туров, С.С. Фолитарек, Г.П. Дементьев провели большую работу по изучению орнитофауны бассейна озера. Ими была собрана большая коллекция птиц.