Недостаток ракеты, который выявился ещё на испытаниях, состоял в слабой избирательности ГСН. Причём случалось, что ракета выбирала цель по своему усмотрению. Так в 1964 г. в авиации ТОФ был случай, когда экипаж 49 мрап, выполняя практический пуск К-10С на полигоне, попал в японский лесовоз, следовавший из Николаевска-на-Амуре и оказавшийся в запрещённой для плавания акватории. Лесовоз спасло то, что ракета устанавливалась на ликвидацию за 400 м до цели и только отдельные её фрагменты повредили надстройки, а двигатель – пробил оба борта. Один человек из команды лесовоза получил ранения и судну пришлось выполнить заход в Холмск для оказания ему медицинской помощи. По слухам с лесовоза пришла телеграмма с соболезнованиями по случаю гибели летчика самолёта-истребителя.
Для улучшения избирательности и повышения надёжности ракету вскоре дополнили вторым контуром управления. На эти и другие работы ушло более шести лет. Расчёты показали, что модернизация продлила срок службы Ту-16К-10 на 15 лет и более.
Модернизированный комплекс получил обозначение Ту-16К-1 ОСН. При пуске с максимальной дальности самолёт к моменту встречи ракеты с целью приближался с ней на 265 км, а не 140 км как раньше.
Сокращению времени подготовки ракетоносцев к вылету способствовало закрепление ракет К-10 20 носителями. Предварительно перед закладкой ракет в боевой комплект (эК) производилась их проверка и облёт в воздухе.
В частях ракетоносцев за подготовку средств систем отвечала специальная инженерная служба полка (СИС). Кроме того, в полках имелась ремонт- но-техническая база, обеспечивающая содержание ракет на длительном хранении (ракеты второго и последующих БК) и в подготовке к вылету полка по тревоге участия не принимавшая.
В авиации СФ пришли к выводу о целесообразности изменения существующего порядка и реорганизовали СИС, разделив её между инженерно- авиационной службой (ИАС) полка и ремонтно-технической базой. Всё, что относилось к самолёту-носителю стала готовить ИАС, а то, что к ракетам – РТБ. После таких преобразований СИС оказалась лишней. Благодаря новациям количество аварийных пусков ракет К-10С и КС по вине ИАС в 1962 г. по сравнению с предшествующим годом удалось снизить соответственно на 20 и 40 %.
Для сокращения времени подготовки частей к вылету по тревоге провели и другие мероприятия: ракеты первого БК стали содержать со снаряженными БЧ, принимая во внимание, что одна только установка взрывателей занимала 60-65 мин.
