С введением централизованного управления агентурной разведдеятельностью были значительно повышены требования к соблюдению конспирации, без чего невозможно было добиться высокой продуктивности в агентурной работе. Отныне все начальники разведок должны были придерживаться единых правил: всю сеть агентуры должны знать только лица, допущенные к работе с нею; вербующий мог знать только тех агентов, которых завербовал лично; агенты не должны знать друг друга; партизаны, в том числе и их командный состав, не должны знать агентов-маршрутников и их маршруты; связь с агентурой осуществлять строго конспиративно, а материалы, касавшиеся работы с ней, хранить в тайне, а при необходимости сжигать. В 1943 году значительно улучшилось отношение к агентуре, в том числе и из вражеской среды. Агентам, завербованным из числа лиц, находившихся на службе у немцев, выдавались удостоверения, в которых указывалось, что предъявитель его выполнял партизанские задания. Удостоверения придавали агентам уверенность в том, что после изгнания оккупантов они и их семьи не будут репрессированы.
Как правило, партизанская агентура, работавшая у немцев, была объединена в резидентуры во главе с резидентом. Только резидент знал всех агентов, входивших в нее, каждый из которых сообщал лично ему добытые разведсведения. Некоторые агенты, если это диктовали обстоятельства, работали в одиночку, переправляя данные при помощи связных через заранее обусловленные тайники («почтовые ящики»).
Важным аспектом создания резидентур была подготовка агентов и связных. Агентурных разведчиков обучали в спецшколах штабов партизанского движения. Курс обучения составлял всего 10 дней, в течение которых проводились занятия по 10 часов в сутки. За 100-часовой курс обучения в течение 50 часов изучался курс специальной подготовки, 30 часов — курс военной подготовки, 6 часов отводилось на политподготовку и 4 часа — санподготовку. Главной задачей обучения была выучка специалиста, владевшего методами агентурной работы и конспирации, знавшего обстановку на оккупированной территории в предполагаемом районе действий и готового самостоятельно выполнить поставленные задачи. Так как почти все мужчины активного возраста были призваны в действующую армию, находились в партизанах или на службе у немцев, агенты вербовались в основном среди женщин и подростков. Кроме того, эта категория жителей вызывала у оккупантов меньше подозрений, чем мужчины. Важную роль в разведке играли связные. Они являлись своего рода маршрутными разведчиками и выполняли следующие задачи: передавали на Большую землю разведданные и доставляли оттуда указания; осуществляли связь с разведывательно-диверсионными группами и подпольем; доставляли в штабы партизанских формирований интересовавшие их материалы; вели разведку на маршруте следования.
