Несмотря на то, что в конце июля – начале августа штаб 9-й ШАД несколько снизил наряд сил. выделяемых для ударов по немецким базам, результаты продолжали оставаться достаточно высокими. Например, 2 августа получила повреждения и затонула на мелководье MALI6. были потоплены четыре (V-124, -135. -241. -223) и серьезно повреждены два (V-241. V-233) сторожевых катера. Удивительно, но командование КБФ сочло результаты боевой работы своих штурмовиков недостаточными, а угрозу со стороны немецкой 4-й флотилии не устраненной. Поэтому 5 августа 9-я ШАД вновь перешла к нанесению массированных ударов. По судам на реке Эма-Иыги в тот день действовали 40 штурмовиков под прикрытием 30 истребителей. На следующий день в налете на те же цели участвовали уже 68 ударных самолетов. Впрочем, с 7 августа интенсивность налетов снова упала: один удар (4 штурмовика) – в тот день, два (4 и 7 «Илов») – на следующий. Вероятной причиной такого резкого падения активности явилось тяжелейшее положение с авиационным бензином, сложившееся на флоте.
Тем временем продвижение советских войск к Тарту наконец-то перевело вопрос о десанте в практическую плоскость. Директивой командующего 3-м Прибалтийским фронтом от 12 августа была создана десантная группа, которую возглавил заместитель командующего фронтом генерал-лейтенант А.А. Гречкин. Из состава 25-й бригады речных кораблей, насчитывавшей на 13 августа 12 бронекатеров, 21 тендер и ряд других плавсредств, были сформированы три десантных отряда и отряд кораблей артиллерийской поддержки. Наступал «момент истины» – то. ради чего собственно КБФ и разворачивал свои силы на Чудском озере. Операция началась в ночь на 16 августа и первоначально проходила согласно разработанным планам – к пяти часам утра первый эшелон десанта был благополучно переправлен на западный берег. Немцы пытались помешать высадке, однако их огневые точки немедленно подавила наша артиллерия. Катера вернулись за вторым эшелоном, и казалось, что все -идет, как по маслу», но быстро оправившийся от неожиданности противник сделал свой ответный ход. В 10.00 и в 12.40 немецкие самолеты группами по 18- 25 машин нанесли удары по десантно-высадочным средствам 25-й бригады. В результате несколько катеров было повреждено, а минный катер МК-5, буксировавший понтон с людьми и техникой, потоплен. До конца суток люфтваффе совершили еще три крупных налета. Были потоплены суда, на которых находился 3-й батальон 546-го стрелкового полка, санитарная рота этой части, артиллерийская батарея, боеприпасы и продовольствие. Погибло много солдат и офицеров. К исходу дня в строю осталось не более 30% тендеров, остальные были повреждены или уничтожены авиацией противника. Удары авиации 1-го ВФ продолжились и на следующий день. К 23 часам 17 августа 25-я бригада речных кораблей безвозвратно потеряла бронекатер, три тендера, два минных катера и два катера-тральщика. Из 14 паромов затонули семь. Для восполнения этих потерь командование КБФ приказало срочно подготовить к отправке в Гдов 6 бронекатеров и 20 тендеров из состава Кронштадтского морского оборонительного района.
