Положение в районе Новороссийска вызывало острое беспокойство у вышестоящего командования. Во время переговоров по прямому проводу вечером 4 сентября командующий Черноморской группой войск выразил командующему НОР генерал-майору Г. П. Котову неудовольствие тем, что ошибки в руководстве войсками привели к потере ряда позиций и окружению 103-й стрелковой бригады. Он потребовал наладить твердое управление частями и форсировать занятие войсками внутреннего обвода, считая его главным рубежом сопротивления. Заместителю командующего НОР по морской части было приказано взять на себя непосредственное руководство действиями по обороне города и расстановкой в нем войск.
На следующий день Военный совет Черноморской группы войск детализировал указания по дальнейшему совершенствованию обороны, созданию заграждений на дорогах, ведущих к Новороссийску, сосредоточению огня на главных направлениях.[152] Но времени на их выполнение уже не было. Утром 5 сентября противник начал [162] ожесточенные атаки на ближних подступах к городу. Основной удар наносился со стороны западной и северо-западной окраин. Наши части самоотверженно отстаивали свои позиции, но к вечеру вражеским войскам удалось выйти на северо-западную окраину Кирилловки, к колхозу «Красная заря», на северную окраину Борисовки, к колхозу «Победа» и к Федотовке, находившимся в 3–4 км от города. Новороссийск почти непрерывно бомбила авиация и обстреливала артиллерия.
В полдень 6 сентября по Анапскому шоссе от Тоннельной в город прорвались вражеские танки и автоматчики. В ожесточенном бою морские пехотинцы остановили их в районе хлебозавода.
В это же время противник сумел прорвать оборону 15-го отдельного батальона морской пехоты и к вечеру занять железнодорожный вокзал. Одиночные танки, штурмовые орудия и группы автоматчиков проникли в районы порта, Холодильника, завода «Красный двигатель» и цементного завода «Пролетарий». Батальоны морской пехоты, оборонявшиеся в центральной части Новороссийска, оказались отрезанными от основных сил. В предместье Мефодиевской шли упорные бои. Продвижение противника на этом направлении было приостановлено в районе цементного завода.
Наши войска упорно защищали каждую пядь земли и постоянно контратаковали противника. 1-й отдельный батальон морской пехоты выбил вражеских автоматчиков с высоты 307,2 у дороги, ведущей от Глебовки к Новороссийску. 2-й отдельный батальон прочно удерживал оборону в центральной части города. 1-я бригада морской пехоты вела бои севернее и северо-западнее города с танками и пехотой противника, наступавшими вдоль дороги Неберджаевская — Липки. 17-й отдельный батальон морской пехоты, вместе с армейскими частями сражавшийся у Кирилловки и Борисовки, понес большие потери и в конце дня был отведен на переформирование. Части 83-й морской стрелковой бригады с тяжелыми боями также отходили к городу.
