В 1986 г. Ф. Дж. Айала в журнале «Общая биология» при сопоставлении маркерных достоинств белков и ДНК предпочтение отдал последней, мотивируя тем, что белки кодируют в геноме высших организмов лишь 5-10 % генов.
Дело в том, что белки кодируют самую существенную часть генов генома — «структурные гены». Остальная часть геномной ДНК, как известно, выполняет регуляторную, стабилизирующую и другие функции вспомогательного или, как говорят, служебного, значения. Некодирующие области генома в функциональном отношении изучены еще недостаточно. Но то, что мы знаем о них, уже свидетельствует об участии их в обеспечении генетической и биологической специфичности организма через биосинтез белков. Другими словами, как ингредиенты генома, представляющего собой генетическую систему видовой категории, некодирующие области, несомненно, в роли регуляторов и кофакторов участвуют в видоспецифическом синтезе белков и формировании соответствующих родовых, видовых, сортовых, биотипных и других белковых признаков.
Кстати, низкий процент в геноме генов, маркируемых белками у высших организмов, есть не что иное как показатель очень высокой сложности структурной и функциональной организации генного, как и всего их генетического аппарата; самый высокий он у простейших, что и позволило именно на них впервые изучить молекулярный механизм работы гена. По последним данным молекулярных биологов, работающих по проблемам генома, белок-кодирующих генов в геноме человека порядка 30–40 тыс. — примерно лишь вдвое меньше их у червей или мух. Но зато они во много раз сложнее, с более альтернативным сплайсингом, генерирующим большее число белковых продуктов. Поэтому полный набор белков (протеоме) у позвоночных намного богаче, чем у беспозвоночных, особенно за счет специфических белковых доменов. Соответственно, оценивать маркерные достоинства белка по проценту маркируемых им локусов в геноме, как это делают некоторые молекулярные биологи, — грубейшая ошибка.
Принципы и методы белковых маркеров уже давно проверены в практике селекции и семеноводства, где они хорошо зарекомендовали себя, и только по незнанию проблемы или по каким-то иным причинам, не связанным с наукой, некоторые генетики-растениеводы, к сожалению, неожиданно и настойчиво вдруг стали выступать против использования их в семеноводстве.
Особенно курьезно выглядят мотивировки этих оппонентов, когда они считают, что белки не маркируют «спящие» гены, поэтому не могут выявлять «скрытую генетическую изменчивость». Как я уже неоднократно писал и говорил, возможность обнаружения у растений скрытой генетической изменчивости — одно из многих достоинств методов белковых маркеров.
