Наполеон отказывался принимать участие во внутренних распрях или подчиняться внешнему давлению, тем более что компромисса между этими двумя силами достичь было крайне трудно. Существовало огромное количество центров, принимающих решения. Весь организационный процесс был настроен на старый способ принятия решений, которого придерживались предыдущие поколения. Главнокомандующий определял стратегию и тактику, распределяя денежные ресурсы и командные посты. Также он определял порядок разработки и приведения в действие систем награждений и контроля над расходованием бюджетных средств. В основные силы входят солдаты и штат чиновников, то есть гражданские сотрудники, которые исполняют решения, принятые руководством. На старших офицеров и чиновников высшего ранга возложена обязанность контроля за деятельностью основных сил. Генерал Тиар, капеллан императора, объяснил более подробно видение этой системы: «Обычно считают, что в самых для него важных вопросах управления император никогда не прислушивался к мнению Государственного совета. Это большое заблуждение. Конечно, иногда он решался действовать по собственному усмотрению, но часто уступал, если момент для принятия самостоятельного решения был неблагоприятен».
Управленческий стиль Наполеона оставлял очень узкое поле для деятельности его соратников, особенно в реализации на их уровне руководящей идеи. Император вмешивался во все события, которые могли иметь хоть какое-то значение для империи, он считал своим долгом обсудить каждую мелочь и заставить согласиться с его решением. Например, 2 ноября 1804 года он писал Талейрану: «Любой расход или денежное вознаграждение будет одобрен письмом или словом „одобрено“ на полях ваших рапортов. Любое назначение на должность или разжалование будут отмечаться приказом; каждая пенсия в связи с отставкой также будет проводиться приказом».
Одержимый, по словам Моллиена[66], «страстным желанием быть центром всего», Наполеон порой относился к своим министрам как к простым клеркам, отдавая им приказы и ожидая немедленного их исполнения. Так, 6 июня 1806 года он писал министру внутренних дел Шапталю: «Опорные столбы в порту Сен-Жиль в департаменте Вандея могут обрушиться, из-за чего будет невозможен вход в этот небольшой порт, который в настоящее время нам необходим для связи с островом д’Йе, где расположен наш большой гарнизон. Следовательно, надо бы провести ремонтные работы».
Также Наполеон не испытывал доверия к организационным структурам, созданным по принципу пирамиды, где на каждом уровне определены лица, несущие ответственность за исполняемую работу. Предпочитая организационную структуру типа «грабли», где все ответвления замыкались на нем, он привык возглавлять всю иерархическую лестницу, общаясь по всем вопросам напрямую с подчиненными своих министров (непосредственными исполнителями поручений). Поскольку Шапталь был министром внутренних дел, в его подчинении находились Крете, отвечавший за содержание дорог и мостов; Портали, регулирующий вопросы культа; Фуркруа, ведавший народным образованием, и Дено, директор музеев и изящных искусств, но все они напрямую подчинялись Наполеону. В данном случае Шапталь воспринял такое вмешательство в свою область деятельности только из-за восхищения интеллектуальными способностями Наполеона. Вот его рассказ о том, как император представил ему проект создания в Фонтенбло военной школы: «Он усадил меня и в течение двух или трех часов диктовал мне план, состоящий из 517 статей. Я считаю, что ничего более совершенного до сих пор не было придумано человеком».
