Упомянутые выше сложности, встававшие перед церковью и православным обществом провинции в годы Гражданской войны, являлись определяющими в формировании направлений работы совета. Среди них условно можно выделить основные: разрешение повседневных социально-экономических проблем духовенства губернии, обеспечение непрерывности религиозного служения; сбор сведений о репрессированных членах клира, помощь членам их семьей, временное замещение образовавшихся вакантных мест и обращение в органы государственной власти с целью защиты преследуемых; разрешение внутрипричтовых конфликтов; противодействие инославию, особенно сектантству.
Работа по первому из обозначенных направлений была связана с необходимостью поиска финансовых ресурсов. При всей незначительности годового дохода архиерейского дома, ограниченного суммой в 122 500 руб., епархии удалось выполнять свои обязательства перед клиром в изменившихся условиях. Немалые суммы из собранных Смоленским епархиальным советом подлежали передаче в Высший церковный совет – 62 080 руб. за 1919 г.305 Основной проблемой было экономическое давление государственных предтавителей, представителей любых властей в форме произвольных поборов, предпринимаемых отдельными представителями власти, гражданской и военной, с церквей и особенно монастырей. У настоятеля одного из смоленских монастырей красноармейцы потребовали 25 000 руб. Он отказался выдать сумму и бежал. Пришедшие учинили расправу, «убили иеромонаха <…> и одного рабочего и закопали в землю»306. После подобных «нашествий» обители часто оставались разграбленными и встать на ноги больше не могли, исчезая как хозяйственные и религиозные единицы. Среди таких обителей Красногородищенская пустынь, Колочский монастырь Смоленской епархии.
Однако имели место и весьма успешные практики монастырской самоорганизации и адаптации к реалиям Гражданской войны. К числу устойчивых и даже усиливших свои хозяйственные позиции монастырских центров относились Новодевичий монастырь в Петрограде и Вознесенский в Смоленске. О характере взаимоотношений со светскими властями свидетельствует их обращение к игумении Феофании (Рентель, 1918–1935) в официальной переписке конца 1920-х гг. – на письме ее именовали «матушкой игуменией». Нужно отметить, что такие случаи хотя и были редкостью, но не исключительной. Схожим влиянием пользовалась настоятельница крупного Воскресенского Новодевичьего монастыря Петрограда–Ленинграда.
