Уговорить мятежников к полной капитуляции помилованным посланцам не удалось, город пришлось брать штурмом петровскому фельдмаршалу Шереметеву, а зачинщиков вновь отвезли в подвалы ведомства Федора Ромодановского, но это было позднее. Мы же отметим явную подчиненность этого прообраза тайной полиции личной воле монарха, непосредственно занятого вопросами госбезопасности в своей империи в отсутствие сложившихся органов политического сыска на профессиональной основе. Также император, судя по его письму в Москву Ромодановскому от 1709 года, будучи в отъезде в Воронеже, затребовал к себе из его ведомства для личного допроса некоего Зернщикова из числа астраханских лидеров мятежа, видимо не доверив его допрос преображенцам.
Неудивительно, что при Петре было заведено: он раз в неделю принимал Ромодановского с отчетом о следствии в его приказе и сам выносил решения о том, вести дело дальше, освободить обвиняемого или предать суду. Сам же император заслушивал лично доносчиков по делам политического сыска, давая указания по началу следствия или его приостановлению. Приговор виновным тоже определял сам царь, за Преображенским приказом оставалось лишь приведение его в исполнение. Так что оперативной деятельности Преображенский приказ не вел вовсе, а о следственной деятельности при такой организации работы можно говорить с большой натяжкой. Тем более что лавры следствия преображенцы делили с многочисленными временными следственными комиссиями. То есть это был подручный орган для выбивания показаний и их оформления в бумагах. Кроме этого, приказ ведал рядом дел, совсем не относящихся к компетенции настоящих спецслужб, что лишает его права считаться таковой. Из множества указов императора Петра Алексеевича к исполнению Ромодановскому и его приказу некоторые еще хоть как-то сопряжены с вопросами государственной безопасности («Указ не пускать никого в Сибирь без ведома Сибирского приказа»), но большинство совсем из других сфер управления (например, «Указ Преображенскому приказу о введении табачного сбора»). Как и странный для нас сегодня указ Ромодановскому следить силами его приказа, чтобы на похоронах «не выли в голос, как раньше». Да и в письмах Петра I Ромодановскому из действующей армии в годы Северной войны далеко не в каждом вообще затрагиваются вопросы обеспечения политической безопасности в оставленной временно царем империи. Чаще император требует от главы Преображенского приказа все новых поставок в армию пушек и боеприпасов к ним.
