Протасову, как первому члену управы, приходилось часто заменять инспектора, выезжать в уезды для борьбы с эпидемиями, оказывать медицинскую помощь населению не только в Перми, но и в уездах, осуществлять контроль за работой уездных врачей. Его часто вызывали в уезды высокопоставленные чиновники для лечения их. Приходилось свидетельствовать рекрутов, проводить судебно-медицинские вскрытия. Ему персонально было поручено осуществлять контроль за работой Пермского военного лазарета.
В управу поступали книги и инструменты для продажи уездным врачам. Заведование библиотекой управы и продажа книг также были поручены Протасову.
Он имел большую личную библиотеку, включающую как русскую, так и иностранную медицинскую литературу. Он хорошо знал эту литературу. После смерти Протасова 67 книг из его библиотеки были переданы согласно завещанию в библиотеку Пермской духовной семинарии. Несколько его книг в наши дни хранятся в библиотеке Пермского медицинского института.
Большие заслуги И. В. Протасову, а также Ф. X. Гралю принадлежат в распространении оспопрививания в губернии.
Как известно, до открытия Дженнера во всем мире оспопрививание проводилось по методу вариоляции. Так называется метод прививки оспы от больного натуральной оспой к здоровому. Этот метод известен был еще в первобытном обществе. В различных странах существовали различные способы прививки оспы. В Китае, например, высушенные и растертые в порошок оспенные корочки вдували здоровому ребенку в нос. На Урале для прививки оспы широко использовалась баня. Выздоравливающего от оспы ребенка и здорового парили одним веником. Привитые дети нередко заболевали, но, как правило, заболевание протекало легко. Отрицательной стороной таких прививок являлось то, что они не только не способствовали сокращению эпидемии оспы, а даже наоборот, помогали их распространению.
Английский ветеринарный врач Дженнер впервые применил для оспопрививания не человеческую, а коровью оспу. При прививке коровьей оспы человек ее легко переносит и при этом у него вырабатывается невосприимчивость к натуральной оспе.
Оспопрививание по методу Дженнера применяется и в настоящее время. Этот метод дал возможность ликвидировать губительные эпидемии оспы. Книга Дженнера об оспопрививании вышла в 1798 году, а в 1801 году в Москве, в воспитательном доме, Е. О. Мухин уже прививает детям оспу по этому методу.
18 мая 1802 года оспенная вакцина — ниточка, пропитанная лимфой коровьей оспы, — была доставлена в Пермь. Ее прислали из Московского воспитательного дома. Граль привил коровью оспу двухлетним мальчику и девочке. Оспа привилась. Затем он привил им натуральную оспу. Дети не заболели. Так было положено начало оспопрививанию в Перми. Вскоре оспенная лимфа для прививок была передана всем уездным врачам.
