В 1588 году с северо-востока к собору был пристроен придел, освященный в честь Василия Блаженного (1469–1552), мощи которого находились на месте постройки собора. Название этого придела дало собору второе, обиходное название.
К приделу Василия Блаженного примыкает придел Рождества Пресвятой Богородицы, возведенный над местом погребения блж. Иоанна Московского, где покоятся мощи Иоанна Блаженного, обретенные в 1672 году.
В 1670-х годах построена шатровая колокольня.
Собор неоднократно реставрировался. В XVII веке были добавлены асимметричные пристройки, шатры над крыльцами, затейливая декоративная обработка глав (первоначально они были золотыми), орнаментальная роспись снаружи и внутри (первоначально сам собор был белый).
В главной, Покровской церкви стоит иконостас из разобранной в 1770 году кремлевской церкви Черниговских чудотворцев.
Последний (перед революцией) настоятель собора протоиерей Иоанн Восторгов был расстрелян 23 августа (5 сентября) 1919 года. Впоследствии храм был передан в распоряжение обновленческой общины.
В 1929 году собор закрыт, были сняты колокола. Вновь храм начал использоваться для богослужения с 14 октября (праздник Покрова) 1991 года. Богослужения совершаются клириками храмов в Зарядье и Китай-городе.
С 1990 года храм-музей стал снова собирать колокола. В настоящее время эта коллекция — одна из самых богатых в России. Всего в музее 19 колоколов, созданных в 1547–1996 годах (места отливки — Урал, Ярославль, Москва, а также Франция, Голландия, Германия, Западная Белоруссия). Колокола отлиты такими известными мастерами, как Федор и Иван Моторины, Семен Можжухин, П. И. Оловяшников, П. Н. Финляндский, А. А. Самгин. Собор имеет также интересную коллекцию оружия времен Ивана Грозного.
Покровский собор — одна из самых известных достопримечательностей России. Для многих жителей планеты это символ Москвы (такой же, как Эйфелева башня для Парижа). Перед храмом размещается бронзовый памятник Минину и Пожарскому (установлен на Красной площади в 1818 году).
В Санкт-Петербурге находится мемориальный храм, посвященный Александру II, — храм Воскресения Христова, более известный как Спас на Крови (завершен в 1907 году). Покровский собор послужил одним из прообразов при создании Спаса на Крови, поэтому оба сооружения имеют черты сходства.
Темнота на полном серьезе может давить — понять это можно, только оказавшись на глубине несколько километров под водой или, если пучина океана тебе недоступна, просто забравшись под землю. И тогда ты сполна прочувствуешь, что такое настоящий мрак, который, кажется, пронизывает каждую клеточку твоего тела. И не помогает даже самый яркий фонарь.
