Едва партия Баас пришла к власти, как началась ожесточенная идеологическая борьба между двумя главными соперничавшими лагерями. Первый, вобравший в себя левые силы и часть военных, возглавлял генеральный секретарь партии Али Салех ас-Саади. Он ратовал за фундаментальную и быструю трансформацию иракской социально-политической системы в социалистическое государство. Другой лагерь, включавший фракцию правых сил, поддерживали армейские офицеры, не состоявшие в партии Баас. Эта группа выступала за эволюционный путь к социализму. Среди тех, кто входил в данный лагерь, был командующий военно-воздушными силами генерал Хардан ат-Тикрити (Hardan al-Tikriti).
Фракция аль-Бакра находилась между этими течениями, однако больше склонялась к правому крылу. Эта центристская фракция была явным аутсайдером в плане идеологической программы и политической активности своих членов. К тому же центристы не очень-то активно защищали свои политические взгляды. В то же время аль-Бакр и его последователи усердно трудились в интересах примирения двух соперничавших лагерей. Они понимали, что будущее Баас зависит от ее единства. В противном случае партия потерпит крах.
Именно ради партийных интересов центристы и вступили в непримиримую борьбу. На специальной сессии регионального командования, которая проходила 11 ноября 1963 года, группа левых была исключена из рядов Баас. Генерального секретаря Саади и четырех его ближайших помощников арестовали прямо во время работы сессии. Правда, им разрешили эмигрировать в Испанию. Все это вызвало волну недовольства в Багдаде, переросшую в насилие. Ирак оказался на грани гражданской войны. Национальная гвардия свирепствовала на улицах столицы, убивая и грабя население.
С целью найти компромиссное решение в Ирак прибыла сирийская делегация, возглавляемая Мишелем Афлаком, генеральным секретарем Баас. Однако в этой сложной ситуации примирение оказалось невозможным. Единственный выход — исключение из партии представителей обоих экстремистских лагерей. И уже через день прибывшие из Сирии члены национального командования исключили группу активистов правого крыла регионального командования, а его руководителям было предложено уехать в Бейрут (89). В руководстве иракской партии Баас образовался вакуум. Сирийское национальное командование повело себя так, как будто оно несло ответственность за состояние дел в иракском филиале Баас.
Это было фатальной ошибкой. Действия сирийских эмиссаров были восприняты так: национальное командование партии Баас вмешивается во внутренние дела Ирака и грубо нарушает его суверенитет. Авторитет баасистов сильно упал. Это, в свою очередь, позволило президенту Абдель Саляму Арефу, который занял свой пост благодаря Баас, предпринять решительные действия против своих прежних благодетелей.
