Гидравлическая система включает две автономные системы, каждая из которых питается от своего гидронасоса, установленного на двигателе. Рабочее давление в системах — 211 кг/см². Имеется также резервный гидронасос, работающий от аварийного электрогенератора. Обе системы обеспечивают работу рулевых поверхностей и закрылков. Выпуск-уборка шасси и тормозного щитка, управление передней опорой и тормозами колес шасси, работа электрогенератора стабилизированной частоты производятся только одной из гидросистем.
Система электроснабжения использует генератор переменного тока с приводом от двигателя, который вырабатывает ток нестабилизированной частоты 320-520 Гц и напряжением 115/200 В. Имеется также генератор переменного тока с гидравлическим приводом постоянных оборотов. Он обеспечивает потребители током стабилизированной частоты 400 Гц и напряжением 115/200 В. Аварийный источник переменного тока — генератор с приводом от вспомогательной воздушной турбины. Потребители постоянного тока напряжением 28 В питаются через трансформатор-выпрямитель. Аварийный источник постоянного тока — две аккумуляторные батареи.
Бортовое радиоэлектронное оборудование включает навигационную систему, систему автоматического управления, систему управления оружием, радиостанцию ДМВ-диапазона, систему предупреждения об облучении РЛС противника AN/APS-54 и систему идентификации «свой-чужой» с самолетным ответчиком A/ARN-31 ILS либо AN/APX-6A, а на доработанных истребителях — AN/APX-25.
Навигационная система состоит из инерциальной навигационной системы, радиотехнической системы ближней навигации AN/ARN-21 (TACAN) и радиокомпаса AN/AR -6.
Система автоматического управления включает автопилот Minneapolis-Honeywell МВ-3 с автоматом стабилизации параметров полета, который обеспечивает автоматическое демпфирование колебаний самолета, стабилизацию его углового положения и барометрической высоты.
Система управления оружием обеспечивает атаку воздушных и наземных целей. Она включает радиолокационный дальномер AN/APR-25, сопряженный с коллиматорным прицелом А-4 в кабине летчика. При бомбометании и пуске НАР используется система управления огнем М-1, адля низковысотного сброса тактической ядерной бомбы Мк.7 — система МА-2 (LABS). На самолетах поздних серий (начиная с F-100D-20) эта система замена на AN/AJB-1B, которая обеспечивает сброс ядерных бомб Мк.28, Мк.43 и Мк.61.
Вооружение самолета. Встроенное артиллерийское вооружение — четыре одноствольные револьверные пушки М39 (Pontiac Т-160) с боезапасом по 200 снарядов на каждую. Калибр пушки — 20 мм, максимальная скорострельность — 1500 выстр./мин, начальная скорость снаряда — 870 м/с. Используются снаряды серии М50. Револьверный заряжающий механизм представляет собой пятизарядный барабан с ленточным питанием и газовым приводом с электроспуском.
