На вооружение Королевских Воздушных Сил Дании (Det Kongelige Danske Flyvevaben — DKDF) «Супер Сейбры» начали поступать в мае 1959 г. Ими укомплектовали три эскадрильи, заменив истребители-бомбардировщики F-84G. Самолеты прошли ряд доработок: штатное катапультное кресло было заменено на Martin-Backer Mk-DE5A, установлены система ближней навигации AN/ARN-27, радиодальномер APW-4/APS-54 и модернизированная УКВ-радиостанция.
В Дании, особенно в ранний период эксплуатации, F-100 прославился очень высокой аварийностью. До 1968 г. было потеряно 8 «спарок» и 27 F-100D. В 1967- 68 годах боеготовность флота «Супер Сейбров» опустилась ниже критичного по нормативу НАТО порога в 70%. Так, в тот период выявили усталостные трещины в конструкции крыла, и после минимального ремонта эксплуатационную перегрузку снизили до величины в 4 д. Это ограничение сняли после установки дюралевых накладок.
В 1973-74 годах было сформировано учебное подразделение OCU, в которое поставили доработанные «спарки» TF-100F, оснащенные катапультными креслами «Мартин-Бейкер». Работа OCU дала результат, квалификация летчиков выросла, и пару лет «Супер Сейбры» эксплуатировались безаварийно. Однако затем стал сказываться возраст самолета. В 1976 г. DKDF потеряли сразу 6 «сотых», еще 3 разбились в 1977 г. Полеты всего парка снова остановили. После ремонтных работ и замены форсажных камер истребители летали без потерь. От последних «Супер Сейбров» датчане избавились в 1982 г.
В том же году американская компания Flight System Inc. (FCI) приобрела 4 бывших датских TF-100F, которые затем были доработаны в буксировщики мишеней. Они получили гражданскую регистрацию и белую глянцевую окраску с продольной темно-синей полосой на фюзеляже. До 1992 г. компания FCI использовала эти машины в интересах USAF в Европе. Полеты выполнялись с аэродромов Великобритании и Италии. Затем эти самолеты перегнали в США, где их эксплуатация продолжалась до 1997 г. Необходимо отметить, что до 1992 г. та же компания использовала в США в качестве буксировщиков мишеней 8 «Супер Сейбров», 4 из которых представляли дооборудованные F-100D/F, а еще 4 были бывшими мишенями QF-100, возвращенными к пилотируемой конфигурации.
Воздушные Силы Турции (Turk Flava Kuvvetleri — ТНК) располагали самым большим парком «Супер Сейбров» среди американских союзников. К лету 1974 г. количество эскадрилий (Filo), вооруженных «сотыми», достигло пика. Сразу шесть подразделений (111-я, 112-я, 131-я, 132-я, 171-я и 172-я Filo) летали на истребителях этого типа.
