Однако в последующем выяснилось, что, создав подобные органы военного управления, высшее военное руководство не смогло в полном объемы определить их задачи, разработать соответствующую нормативную базу по их функционированию. Поэтому иногда люди, носившие на своих плечах очень большие звезды, сами толком не знали, что же от них, собственно, требуется. В конечном итоге, после того, как подули «ветры перемен», в начале 1990-х гг. и ставки войск на ТВД, и управления ВВС были сокращены.
Но изменения коснулись не только стратегического уровня управления: «досталось» и оперативному звену. В 1980 г. в военных округах взамен существовавших до этого ВА были созданы ВВС военных округов, а основная масса овп и обвп была передана из ВВС в состав АА. Таким образом, фронтовая авиация и авиация ПВО были сведены в ВВС ВО (групп войск), подчинявшихся их командующим (в военное время - командующим фронтами). При этом бывшие командующие ВА становились заместителями командующих войсками округов - командующими ВВС ВО.
Фронтовой комплект ВВС ВО находился под непосредственным управлением командующего ВВС ВО, а армейский - командующих общевойсковыми и танковыми армиями. Главной целью подобных преобразований было разделение формирований ВВС по назначению, что должно было улучшить взаимодействие фронтовой и армейской авиации с войсками фронта при совместном выполнении задач.
Кроме того, в результате реформы Дальняя Авиация преобразовывалась в две ВА ВГК СН (стратегического назначения), которым придавались и бад на Су-24 (например, 21-я бад в составе 30-й ВА). Также в 1984 году Главные командования войск ТВД в военное время получали в оперативное подчинение две созданные ВА ВГК ОН (оперативного назначения) - 4-ю (Легница, ПНР) и 24-ю (Винница). В мирное время ВА ВГК СН и ВА ВГК ОН подчинялись главному командованию ВВС.
Здесь стоит отметить, что в авиации ПВО подобные эксперименты проводились и ранее: в 1978 году восемь иап из состава авиации ПВО, дислоцировавшиеся на территориях Прикарпатского и Прибалтийского ВО, на основании директивы МО СССР от 18 ноября 1977 г. передавались в оперативное подчинение ВВС. Остальные же иап были переданы в подчинение командующим ВВС ВО на основании директивы ГШ ВС СССР от 05 февраля 1980 г.
Несмотря на то, что главной целью реформ было совершенствование структуры ВС и системы управления ими, добиться положительных результатов на этом поприще так и не удалось: они оказались чрезмерно сложными, децентрализованными.
