И, безусловно, Ельцин отказался служить компартии не для того, чтобы служить Бурбулису и группе собранных им молодых авантюристов.
Тем не менее, по некоторым данным именно он был основным автором проекта Указа Ельцина о роспуске парламента в сентябре 1993 года. Фактически возглавил президентский штаб по борьбе за его реализацию. А когда его обвинили в выходе из конституционного поля, заявил, что не может считать этот текст Конституцией.
Бурбулис стал вреден. Уже не только для страны — но для власти самого Ельцина.
В 1993-м и 1995 году он еще изберется в Государственную Думу. В 1999 избиратели голосовать за него уже откажутся. Зато в порядке компенсации губернатор Новгородской области Михаил Пруссак сначала сделает его вице-губернатором, а затем, после изменения порядка формирования Совета Федерации, назначит своим представителем в последнем. И Бурбулис, отвергнутый и страной, и Ельциным, и избирателями — будет в верхней Палате представлять ту самую область, избиратели которой отказали перед этим ему в доверии представлять их в Палате нижней. А когда свой пост потеряет его последний покровитель и на место губернатора будет назначен Сергей Митин, все годы властного разгула Бурбулиса проработавший на Горьковском производственном объединении «Завод имени В. И. Ульянова» и на себе ощутивший последствия его авантюр — станет ясно, что вместе они работать не смогут. Бурбулис вынужден будет оставить и место в Совете Федерации, в котором возглавлял комиссию со странным названием «по методологии реализации конституционных полномочий Совета Федерации» — ведь когда-то он был заместителем директора института как раз по методической работе.
Некоторое время он побудет еще советником председателя Совета Федерации, инициирует создание и станет заместителем (опять заместителем!) руководителя Центра мониторинга законодательства и правоприменительной практики (Центра мониторинга права) при Совете Федерации Федерального Собрания Российской Федерации, — но к 2010 году окажется, что его советы и его доклады приносят пользы не больше, чем его советы Ельцину когда-то. Он потеряет и эту должность.
Вузовское прошлое пригодится и после отставки: соратник по Межрегиональной депутатской группе и политической деятельности рубежа 1980–1990-х Гавриил Попов возьмет его проректором в свой Международный университет, созданный в августе 1991 года по совместному решению Горбачева и Джорджа Буша-старшего. Правда, тоже на интересную должность — по инновационному развитию.
