Депутат имел право состоять в одной фракции или депутатской группе. Был разрешен свободный переход из одной фракции в другую. В Думе образовались следующие группы-блоки: реформаторы — «Выбор России», «Яблоко», ПРЕС и группа депутатов во главе с Ириной Хакамадой и Борисом Федоровым, центристы — «Новая региональная политика», «Женщины России», «Демократическая партия России», левая оппозиция — КПРФ, Аграрная партия России, группа депутатов «Российский путь».
Победившая на партийных выборах в Государственную думу ЛДПР стала оппозиционной партией. Такова политика. При голосовании часто побеждала «неформальная коалиция» — партийный блок из НРП, ПРЕС, «Женщины России», ДПР и в некоторых случаях АПР. Лидеры этих фракций часто общались с тогдашним председателем правительства РФ В.С. Черномырдиным. Председателем Госдумы стал представитель АПР Иван Рыбкин. Другие должности были распределены по «портфельному соглашению» — в зависимости от численности депутатов фракции.
ЛДПР удалось создать Комитет по геополитике. Первоначально его не было. Заместителем председателя Государственной думы стал член фракции ЛДПР А. Венгеровский. Представители партии были избраны председателями пяти комитетов — по вопросам геополитики, по ресурсам и природопользованию, по промышленности, строительству, транспорту и энергетике, по труду и социальной политике, по экологии.
Руководитель фракции ЛДПР В.В. Жириновский вошел в Совет Государственной думы.
Государственную думу из 450 депутатов возглавил председатель, у которого был один первый и несколько простых заместителей. В руководство также входили лидеры фракций и депутатских групп, председатели думских комитетов и комиссий; их в Думе бывало от 20 до 40. В комитетах действовало несколько подкомитетов.
Расписание работы Думы было следующим:
В понедельник работали и заседали комитеты и комиссии.
Во вторник с утра проходило заседание Совета Думы, затем собрание фракций и депутатских групп, к вечеру — парламентские слушания.
В среду — пленарное заседание Государственной думы.
В четверг с утра — заседание Совета Думы, потом работа комитетов и комиссий, во второй половине дня — собрание фракций и групп.
В пятницу — пленарное заседание.
У депутата нет начальников, все депутаты равны.
Лидер ЛДПР вспоминал о работе Думы созыва 1993 года:
«Помню первые заседания Совета Думы.
Мы сидели почти рядом за большим круглым столом. Посредине — председатель Госдумы Иван Рыбкин. Мы — лидеры фракций — вокруг него. Разговор шел предельно откровенный, без излишней дипломатичности. Иногда ругались.
