В середине августа 1939 года началась мобилизация Кригсмарине, а потом и стратегическое развертывание. Ранним утром 6 сентября на рейде Вильгельмсгафене стояло соединение немецкого флота. В его состав входили крейсера "Нюрнберг" и "Лейпциг", с грузом мин эсминец "Георг Тиле" и 3 миноносца 6-й флотилии "Зееадлер", "Вольф" и "Ильтис", они должны были нести противолодочную оборону соединения. Целью операции была постановка очередного фрагмента минного заграждения "Вествалл". 15 сентября "Зееадлер" принимает участие в очередной минно-заградительной операции. Миноносец находится в составе группы прикрытия, которой командовал командир 2-й флотилии эсминцев капитан 1 ранга Бочте. 26 сентября миноносцы 6-й флотилии "Зееадлер", " Вольф", "Ильтис" и " Леопард" выходят в Каттегат. Цель операции перехват контрабанды, идущей в Англию.
В ноябре 1939 года начались по стоянные походы немецких эсминцев к британскому по бережью, где они ставили мины. Эс минцы ночью ста вили мины и пол ным ходом отходили к своему побережью. Если же эсминцы будут перехвачены вражескими кораблями, то они должны были отходить к заранее развернутым своим крейсерам, в охранении которых находились миноносцы. Впервые " Зееадлер" принял участие в подобной операции в ночь с 12 на 13 ноября 1939 года. В эту ночь 4 эсминца поставили мины в устье Темзы, а у Таршелинга были развернуты крейсера разведывательных сил " Нюрнберг" и "Кенигсберг", в их охранении находились, помимо " Зееадлера", миноносцы " Леопард", "Ильтис" и "Вольф". В ночь с 17 на 18 ноября 3 эсминца вновь поставили мины в устье Темзы, в районе банки Торшелит находились в полной боевой готовности крейсера "Лейпциг" и " Нюрнберг" и миноносцы "Леопард", "Зееадлер" и "Ильтис". В ночь с 18 на 19 ноября другие три эсминца поставили мины в устье реки Хамбер. Для их прикрытия в море вышли " Лейпциг", "Зееадлер", "Ильтис" и "Вольф".
С 21 по 22 ноября "Зееадлер" снова находится в море в составе соединения командующего разведывательными силами вице-адмирала Денша. В него вошли броненосный корабль, "Лютцов", крейсера "Кёльн" и "Лейпциг", и три миноносца 6-й флотилии "Леопард", "Зееадлер" и "Ильтис". Целью был контроль над судоходством в проливе Скагеррак. Эта операция плавно переросла в следующую: линейные корабли " Шарнхорст" и "Гнейзенау" должны были совершить нападение на вражеские корабли так называемого Северного патруля. 22 ноября в их охранении находилась также и 6-я флотилия миноносцев ("Леопард", "Зееадлер", "Ильтис" и "Вольф").
