В конце 1943 года Министерство авиации разработало официальную схему обозначения вариантов Mk.IX:
F.IXC (прежний Mk.IXA) — самолет с двигателем «Мерлин 61» или «63» с крылом типа С.
LF.IXC (прежний Mk.IXB) — самолет с двигателем «Мерлин 66» с крылом типа С. Хотя литера «L» в названии обычно обозначала оптимизацию под небольшие высоты (low — низкий), в данном случае это было не совсем так. Если F.IXC развивал максимальную скорость на высоте 8500, то LF.IXC имел максимум «лишь» на 6700 м.
HF.IXC — самолет с двигателем «Мерлин 70» с крылом типа С. Этот самолет был оптимизирован под большие высоты.
Но прежде чем официальные документы дошли до боевых частей, там уже устоялись стихийные обозначения Mk.IXA и LH.IXB.
С 1944 года небольшое число «Спитфайров IX» переделали в самолеты фоторазведки FR. IX, установив в хвостовой части фюзеляжа диагональную фотокамеру, направленную влево. При этом с некоторых самолетов снимали вооружение, а на некоторых вооружение оставляли.
Новые Mk.IX, выпущенные летом-осенью 1944 года, имели пять особенностей. В порядке внедрения в производство это были: гироскопический прицел Mk.II, крыло тип Е, руль направления большей площадью, каплевидный фонарь кабины с пониженной хвостовой частью фюзеляжа, наконец, дополнительные бензобаки в хвостовой части фюзеляжа. Хотя все эти доработки значительно улучшили боевые качества самолета, они никак не обозначались в названии самолета.
Гироскопический прицел Mk.II позволял пилотам брать поправку при стрельбе на вираже или по целям, движущимся поперечным курсом. Пилоты, освоившие работу с прицелом, стреляли значительно метче. В 1944 году провели анализ 130 боев с участием «Спитфайров IX», оснащенных стандартным прицелом. В их ходе пилотам удалось сбить 34 самолета противника, то есть результативность составляла 26 %. В то же время одна эскадрилья, летавшая на Mk.IX с гироскопическим прицелом, в ходе 38 боев заявили 19 побед, то есть добились 50 % результативности. То есть введение гироскопического прицела вдвое повысило эффективность стрельбы. Гироскопический прицел сильно облегчил положение союзников в последние месяцы войны, когда противник все шире применял реактивные истребители. В результате немцы теряли два реактивных истребителя на каждый один сбитый поршневой самолет союзников.
Крыло «тип Е» значительно повысило эффективность огня. Прежнее крыло «тип С», несшее две 20-мм пушки и четыре 7,7-мм пулемета, испытывало заметные деформации при активном маневрировании. В результате юстировка стволов нарушалась, и очереди шли куда угодно, но только не туда, куда указывал прицел. Кроме того, эффективность 7,7-мм пулеметов была минимальна, так как все немецкие самолеты имели достаточное бронирование для защиты от пуль винтовочного калибра.
