Французская армия в Египте, даже не получая подкреплений, продолжала боевые действия. В марте 1800 г. генерал Ж.Б. Клебер разгромил пришедшую из Сирии турецкую армию.
Тогда английским правительством был разработан план высадки 20 000 английских войск западнее устья Нила для совместных действий с сирийской армией турок. В конце 1800 г. в Гибралтаре сосредоточился флот и сухопутные войска адмирала Д. Кейта и генерал-лейтенанта сэра Р. Аберкромби для действий против французской армии в Египте. 31 января 1801 г. флот подошел к берегам Малой Азии (Анатолии) в бухту Мормарис Туда же пришли турецкие суда.
Английский корпус генерала Р. Аберкромби (17 тысяч) с эскадрой Д. Кейта (135 судов) 22 февраля 1801 г. отправился к Египту и прибыл 1 марта 1801 г. на Абукирский рейд. 8 марта англичане начали высадку. Благодаря значительному количеству плавсредств они высадили на берег сразу 6 тысяч. Начавшаяся этой высадкой кампания привела к капитуляции французских войск в Египте. 31 марта 1801 г. генерал Ж. Мену подписал конвенцию об очищении Александрии и возвращении французских войск во Францию. В сентябре 1801 г. остатки французских войск покинули Египет. Так закончилась Египетская экспедиция Наполеона
Одновременно с посылкой О. Гантома в Египет, Бонапарт решил сосредоточить значительные морские силы в Кадиксе, чтобы действовать на сообщениях английского флота со Средиземным морем. Адмирал Ф. де Брюи получил приказ идти в Кадикс, где находилось около 10 испанских кораблей. Туда же были направлены из Тулона под командованием контр-адмирала Д Линуа три корабля. Однако Ф. де Брюи так и не удалось выйти из Бреста.
Английская эскадра Д. Сомареца (семь линейных кораблей, фрегат и бриг) находилась у Кадикса. Это был передовой отряд эскадры, блокировавшей Брест, который пошел за О. Гантомом.
1 июля 1801 г. у Гибралтара появилась французская эскадра контр-адмирала Д. Линуа, а спустя три дня французы стали на рейде Алжезираса. 6 июля к рейду подошла английская эскадра, которая на следующее утро атаковала французов. Французы отчаянно сопротивлялись, один английский корабль сел на мель и был взят французами. После боя Д. Сомарец отошел к Гибралтару и приступил к исправлению повреждений.
Утром 9 июля пять испанских линейных кораблей, три фрегата и люгер под командованием генерала Д. Ж. де-Моренго направились из Кадикса к проливу и к 15 часам подошли к Алжезирасу с целью сопровождать корабли Д. Линуа.
