В начале 1800 г. английский флот Канала из 38 линейных кораблей крейсировал у Бреста, блокируя франко-испанский флот из 45 линейных кораблей.
Целая цепь мелких судов, находившаяся вдоль северного побережья Франции и берегов Бискайского залива, следила за подвозом к Бресту, который нуждался в огромном количестве материалов и припасов для союзного флота. Результатом этого явилась скудость снабжения союзных кораблей, что делало их неспособными к продолжительному плаванию и возможность им выходить только в исключительно штормовые погоды, которые отгоняли англичан, что обыкновенно приводило к серьезным повреждениям союзных кораблей.
Вследствие этих причин Ф. де Брюи не мог выполнить приказания Бонапарта в феврале 1800 г. выйти из Бреста с 30 союзными кораблями, чтобы перейти в Тулон, освободить Мальту и быть готовым для плавания в Египет.
В Средиземном море эскадра А Кейта блокировала Мальту, а также Геную, помогала австрийцам изгнать французов из Пьемонта и Тосканы.
Наполеон, став 1-м консулом, решил оказать помощь египетской армии генерала Мену. Он заключил союз с Павлом I, и русский флот не препятствовал французам в Средиземном море, объявил войну Португалии, что задержало отправку в Египет с острова Минорка английского корпуса генерала Р. Аберкромби; двинул корпус Сульта в Неаполитанское королевство для занятия портов Бриндизи, Отранто и Тарента, чтобы ими не воспользовались англичане, как наиболее удобными для отправки войск в Египет.
Наполеон также приказал перевезти в Египет 5000 войск. Ввиду отсутствия снабжения для большого флота, Бонапарт приказал контр-адмиралу О. Гантому в октябре 1800 г. выйти из Бреста с семью лучшими линейными кораблями Брестского флота, на которые посадить 5000 солдат и погрузить значительное количество боевых и продовольственных запасов, собранных со всего флота, которые он должен был доставить в Египет.
О. Гантому удалось выйти только ночью 23 января во время жестокого шторма, отогнавшего английскую эскадру от Бреста. 9 февраля он вошел в Средиземное море. Взяв по пути несколько английских судов в плен, французы 19 февраля прибыли в Тулон. Дважды французы выходили из Тулона, чтобы следовать к Египту, но каждый раз, встретив английские корабли, возвращались.
Наполеон приказал О. Гантому сделать еще одну попытку доставить помощь египетской армии. 27 апреля, уже после подписания капитуляции французских войск в Египте, О. Гантом вышел в море и, зайдя в Ливорно и Бриндизи, 7 июня подошел к берегам Египта. Он решил высадить войска к западу от Александрии. Но в тот момент, когда все было готово к высадке, на востоке показались суда лорда Д. Кейта. На судах О. Гантома обрубили якорные канаты, спешно пошли в море и 22 июля вернулись в Тулон.
