5 мая началось теоретическое переучивание на новую машину, а уже 11 мая первые три Як-27Р, пилотируемые летчиками-испытателями МАП, штурманами которых были офицеры полка гв. к-ны Махнов, Баталов и Цыцыма, прилетели из Саратова в Шаталово. 14 мая эта же группа перегнала еще 4 самолета.
47-й ОГРАП первым из разведполков советских ВВС осваивал этот новый сверхзвуковой самолет-разведчик и вырабатывал рекомендации по его эксплуатации на земле и в воздухе, а также по боевому применению.
В течение мая и июня личный состав по 8-10 часов в день изучал матчасть, особенности эксплуатации самолета на земле и в воздухе и практической аэродинамики. Представители ИАС ВВС МВО приняли зачеты, и личный состав был допущен к обслуживанию и выполнению полетов на Як-27Р. 5 июня состоялись первые полеты. Вначале летчик-испытатель НИИ ВВС п-к Глазунов выполнил над точкой комплекс фигур сложного пилотажа, после чего первый самостоятельный полет с разрешения зам. ком. ВВС МВО совершил командир полка. В июне начались массовые полеты на новом самолете, и до конца месяца на Як-27Р самостоятельно летали 16, а к концу года — уже 30 экипажей.
1960. Основной задачей года являлось освоение самолета Як-27Р и проведение в мае-сентябре его войсковых испытаний (ВИ), на основе которых необходимо было выдать рекомендации о боевых и эксплуатационных возможностях нового разведчика, методике самолетовождения и боевого применения во всех метеоусловиях днем и ночью. Для проведения ВИ в апреле в полку выделили специальные экипажи из управления полка и 2-й АЭ.
Одновременно велась подготовка к планировавшимся в июле исследовательским учениям Сухопутных войск «Дон». Требовалось в короткий срок научить все экипажи тактике ведения воздушной разведки ракетно-ядерных средств (РЯС) на новом самолете. Заключительным этапом подготовки стало проведение в мае ЛТУ полка. 11 июля для участия в учениях «Дон» полк в составе двух групп перелетел на аэр. Липецк и Лебяжье, откуда за время учений (с 13 по 20 июля) выполнил 161 вылет на воздушную разведку войск и боевой техники. Это было первое учение с участием большого количества авиации, различной техники и ракетных войск. Оно стало экзаменом боевых возможностей Як-27Р и всего личного состава. По итогам учений полк получил самую высокую оценку.
С 25 августа полк был переведен на новую организационно-штатную структуру ИАС: техсостав эскадрилий выведен из состава боевых подразделений и в виде ТЭЧ АЭ включен в ПАС полка.
