Фердинанд I осознавал, что пока он не в состоянии сломить всю оппозицию, поэтому он использовал дифференцированный подход, определяя для сословий меру наказания за их участие в восстании. Кроме того, Габсбурги рассчитывали внести этим раскол в ряды и без того разобщенной чешской оппозиции. Король использовал в своих целях давнюю конфронтацию между дворянством и городами: он помиловал дворянство и наказал третье сословие — наиболее радикальную часть оппозиции. В итоге дворянство приветствовало антигородские санкции Фердинанда I, как средство ослабления своего конкурента Суровое наказание коснулось всех королевских городов, участвовавших в восстании, но особенно пострадала Прага. В первую очередь, король ослабил города в политическом отношении: они лишались всех своих свобод и привилегий (позже за огромные деньги города могли выкупить у королей свои привилегии). Фердинанд I подчинил все органы городского самоуправления своим представителям — рихтаржам и гетманам. Король ограничил права городских судов и подчинил своей власти апелляционный суд по городским делам. Кроме того, Габсбурги нанесли удар по экономике городов, подорвав еще и этим их политическую самостоятельность. Города были обязаны уплатить Фердинанду I штраф за свое неповиновение, они лишались своих земельных владений, а часть торговых привилегий и налогов также переходили в пользу короля, отныне монарх владел в городах также «правом мертвой руки»^“. Этим король стремился уменьшить значение третьего сословия как политической силы и исключить бюргерство из политической жизни страны.
Дворянство понесло не такое суровое наказание, пострадали лишь наиболее активные заговорщики. Основным наказанием для восставшего дворянства стала конфискация земельных владений, часть из которых Фердинанд I вернул бывшим владельцам уже на условиях лена^'. Таким образом король пытался поставить дворянство в зависимость от себя.
На следующем после восстания сейме Фердинанд I предъявил сословиям требования, ограничивающие их права: запрещались сословные союзы, земские чиновники должны были присягать королю и его наследнику, который теперь мог быть коронован еще при жизни короля Итак, после подавления чешского восстания 1547 г. Фердинанд I смог одновременно ослабить городское сословие и политическую силу дворянства. Победа над сословиями привела к укреплению королевской власти, а единство оппозиции было разрушено. Однако торжество Фердинанда I не означало полную победу
