Разногласия между королем и сословиями в политической сфере усугубились противоречиями по религиозным и финансовым вопросам. С 30-х годов XVI в., вопреки условиям Капитуляций, начались преследования сторонников Реформации и некатолических сект. Но лишь с конца 40-х годов после подавления чешского восстания 1547 г. Фердинанд I перешел к более активной контрреформацион-ной деятельности. Так, королем был возобновлен «Владиславский мандат» 1508 г. против пикартов, гонениям подверглись сторонники «Общины чешских братьев». Большое недовольство сословий вызывала финансовая политика венского двора, не отвечавшая, по их мнению, интересам Чешского королевства. Огромных денежных средств требовали борьба Фердинанда I за венгерскую корону, его войны с Османской империей, а также помощь императору Карлу V в Германии и Италии. Вследствие специфического финансового положения чешских королей (постоянный государственный налог не собирался, снизились доходы королевской казны от регалий, королевский домен практически отсутствовал), Фердинанд I оказался почти в полной денежной зависимости от сословий, поэтому на каждом сейме он просил сословия о сборе берны, причем со временем потребности короля в деньгах все возрастали и он настаивал на повышении уже существующих налогов и введении новых
Первый открытый конфликт чешских сословий с королевской властью произошел в 1547 г. Фердинанд I пытался оказать помощь своему брату императору Карлу V в его борьбе с протестантскими князьями Германии. Поводом для восстания стал Мандат Фердинанда I от 12 января 1547 г. о созыве чешского ополчения. Король не имел права издавать Мандат подобного содержания, этим он нарушил закон, запрещавший ведение войн за пределами королевства без согласия сейма. По мнению Г. П. Мельникова, в этом шаге Фердинанда I не следует искать злого умысла, Мандат говорит лишь о сложном положении, в котором в тот момент оказались Габсбурги Однако чешские сословия расценили поступок короля как попрание своих прав. Их представители, недовольные инициативами Фердинанда I, собрались 17 февраля 1547 г. в Праге. Они издали прокламацию против королевского мандата и создали сословный союз. На открывшемся 17 марта в Праге сейме сословия сформулировали программу борьбы с монархом ‘I
Главной целью выступления было стремление добиться от Фердинанда I отказа от подобных действий. Ничего нового программа не содержала и была по существу консервативной Сословия объявили мобилизацию войск против короля, что уже было нарушением закона с их стороны. Победа Габсбургов над Шмалькальденским союзом внесла раскол в оппозиционное движение чешских сословий: часть дворянства перешла на сторону Фердинанда I. Вооруженное сопротивление королю оказало лишь население Праги.
