Один экземпляр (борт 373), поставленный в августе 1985 г., был сразу же переоборудован в самолёт радиотехнической разведки с неофициальным обозначением Ан-26СМ (An-26SM), ГДРовский аналог Ан-26РТР. Возможно, обозначение происходит от слова «зондермашине» (Sondermaschine) — спецсамолёт. Установленная на Ан-26СМ аппаратура позволяла перехватывать сигналы не только обычных радиостанций КВ и УКВ диапазонов, но и остронаправленных передатчиков, а также засекать рабочие частоты радаров ПВО вероятного противника.
Борт 373 находился в распоряжении Управления разведки Министерства обороны ГДР и с осени 1985 г. еженедельно совершал один-два полёта вдоль границы с ФРГ, прослушивая эфир. Эти полёты, проходившие в обстановке высочайшей секретности, носили кодовое название «Дискант». Официально самолёт вступил в строй 20 декабря того же года. В состав экипажа входили восемь операторов разведоборудования, прикомандированных из 3-го полка РТР (Funkaufklarungsregiment 3) в Дессау — центра электронной разведки Национальной народной армии ГДР. Ан-26СМ оставался в строю до 30 сентября 1990 г., после чего был разоборудован и снова стал обычным транспортным.
Ещё один экземпляр (борт 369) был оборудован для калибровки радиотехнических средств посадки (РТСП) на аэродромах, где базировались истребители МиГ-29. Этот самолёт носил неофициальное обозначение Ан-26М (Ап-26М), от слова «месфлюгцойг» (MeGflugzeug) — буквально «самолёт-измеритель», т. е. калибровщик РТСП.2*
С 1 марта 1986 г. по 5 июля 1988 г. пять машин (борта 364, 367, 368, 371 и 384) выполняли гуманитарную миссию по доставке продовольствия в Эфиопию, сильно пострадавшую от засухи. Поскольку «сверкать» обозначениями ВВС при этом было негоже, самолёты были перекрашены в серый цвет и получили гражданские регистрации — соответственно DDR-SBC, — SBA, — SBB, — SBE и — SBH. Всего Ан-26 выполнили 1543 вылета; по возвращении в ГДР всё вернулось на круги своя.
(Примечание: Согласно Госавиарегистру бывшей ГДР, такие регистрации (DDR-SBA no — SBI и — SBK по — SBN) получили все 12 Ан-26 ВВС ГДР, включая «салоны» и спецварианты, которые выполнять гуманитарные рейсы никак не могли. Более того, указанные в нём даты внесения и вычёркивания этих машин не совпадают со сроками эфиопской опупей. Наконец, оные регистрации были использованы повторно и ранее принадлежали (правда, с префиксом DM) пассажирским Ил-14Л и Ан-24Б авиакомпании «Интерфлюгя. Из соображений места привести здесь эти подробности не представляется возможным.)
