Австро-шведское соглашение включало поставку самолетов, запасных частей, флайт-симулятора, наземного оборудования и подготовку австрийских пилотов на базе шведских ВВС. Совместная комиссия отобрала 24 строевых самолета J 35D, которые для поставки в Австрию были переделаны на заводе Saab в Линчепинге, В период с 25 июня 1987 года по 18 мая 1989 года самолеты поступили на вооружение двух эскадрилий австрийских ВВС. Таким образом австрийские ВВС стали последними эксплуатантами "Дракенов". Модернизированные истребители получили новые серийные номера (351401 -351424) и обозначение J 350Е. Самое заметное внешнее отличие — установка каплевидного фонаря кабины, аналогичного используемому на варианте J 35F. Кроме этого на самолетах было модернизировано электронное оборудование и гарантирован дополнительный ресурс планера не менее 1000 летных часов.
Подготовка австрийских летчиков началась в ноябре 1986 года в Швеции, При этом необходимо отметить, что пилоты встретили сообщение о предстоящих полетах на "Дракене" без особого энтузиазма. Их можно было понять: на вооружение страны принимался истребитель "сэконд хэнд", за которым тянулся шлейф слухов о тенденции к сваливанию в штопор, унесшей жизни нескольких пилотов. Не способствовала повышению настроения и гибель австрийского пилота, совершившего ошибку при выполнении тренировочного полета в ноябре 1986 года. Летчики чувствовали себя обманутыми, и те, кому позволял стаж, уходили в отставку, предпочитая службе в ВВС работу на гражданских авиалиниях. В результате в январе 1990 года на двадцать четыре самолета приходилось только девять подготовленных пилотов. Необходимо отдать должное командованию ВВС — оно сумело преодолеть этот кризис. Используя шведский опыт подготовки личного состава, прекрасное техническое обслуживание и материальное стимулирование, удалось обеспечить эффективную и безаварийную эксплуатацию самолетов в течение восемнадцати лет.
Командир одной из эскадрилий Доро Коватч так отзывался о летных характеристиках Дракена: "Самолет очень хорошо реагирует на малейшее движение ручки управления. На низких скоростях устойчив и прекрасно управляем, но специфика дельтовидного крыла, работающего при посадке на непривычно больших углах атаки, требует от пилота определенных навыков. Дельтовидное крыло малого удлинения, с одной стороны делает самолет малочувствительным к турбулентности, с другой стороны, нужно быть предельно внимательным к предупреждению о выходе на большие углы атаки и возможном сваливании. В этом режиме самолет становится аэродинамически нестабильным и навыки, полученные при полетах на двухместных самолетах, становятся жизненно необходимыми".
