Для борьбы с подводными лодками было привлечено громадное количество моторных и парусных рыболовных судов. Но эти суда, не имея гидроакустики и радиолокации, не могли быть эффективными силами противолодочной обороны.
Потери, понесенные японским торговым флотом, уже в первый год войны значительно превзошли все предположения японского командования. Однако решительных мероприятий по обеспечению и защите морских перевозок принято не было, если не считать некоторого расширения строительства противолодочных кораблей. Общий состав эскортных сил продолжал оставаться недостаточным. В 1943 году противолодочные силы японского флота располагали лишь 50 кораблями, в том числе несколькими эскадренными миноносцами постройки 1920–1925 годов. Находившиеся в составе противолодочных сил четыре эскортных авианосца начали участвовать в сопровождении конвоев только в 1944 году. Организация эскортных сил подчас носила случайный характер. Для сопровождения транспортов выделялись обычно свободные от выполнения других задач корабли. Кроме того, значительное число противолодочных кораблей и кораблей, периодически привлекаемых к эскортированию судов, не имело на вооружении радиолокационных и гидролокационных установок. По-прежнему для целей противолодочной обороны почти не использовалась авиация. Все это создавало весьма благоприятные условия для действий американских подводных лодок на морских и океанских сообщениях против японского торгового судоходства. Подводные лодки не испытывали сколько-нибудь значительного постоянного воздействия сил и средств противолодочной обороны.
Начальное развертывание подводных лодок производилось из Пирл-Харбора (отстоящего от Японии на 3400 миль) и Кавите. С захватом Филиппин подводные лодки из Кавите были переведены в Сурабаю (остров Ява) и Дарвин (Австралия). В дальнейшем, после оставления американцами острова Явы, подводные лодки перебазировались на Фримантл и Брисбен (Австралия); кроме того, были организованы базы в Датч-Харборе и на острове Мидуэй. Все эти базы обладали крупнейшим недостатком — они были значительно удалены от районов боевых действий подводных лодок; на переходы затрачивалось до 10 суток, что сокращало время пребывания лодок на позиции.
Только в 1944 году, с занятием американцами островов в центральной части Тихого океана, были организованы базы в атолле Маджуро (Маршалловы острова) и на островах Сайпан и Гуам. Одновременно были перебазированы и подводные лодки Азиатского флота на Соломоновы острова и остров Новая Гвинея. Приближение баз к районам боевых действий подводных лодок увеличило продолжительность их пребывания на позициях.
