Конклав 1691 года был самым продолжительным из всех конклавов XVII века. Он заседал пять месяцев, с 12 февраля по 12 июля. Ни испанская, ни французская, ни имперская партия не имела намерения выступать против Барбариго. Но с приходом в Рим летней жары кардиналы оказались вынуждены быстро найти приемлемого для всех кандидата. Этим кандидатом стал Антонио Пиньятелли, который и принял 12 июля имя Иннокентий XII.
Новый папа принадлежал к одному из знатнейших семейств Бари. Его отец был принцем де Минерво и грандом Испании. Хорошие отношения с Римской курией помогли будущему папе быстро продвинуться в карьере священнослужителя вплоть до должностей вице-легата в Урбино, правителя Витербо, нунция во Флоренции, Вене и Польше и инквизитора на Мальте. Пребывая именно в мой должности, Антонио Пиньятелли наладил и поддерживал самые тесные отношения с агентами Священного Альянса и его главой, кардиналом Палуццо Палуцци.
В то время на Мальте активно вел дела один ирландский торговец-протестант по имени Уильям Керри. На острове ходили слухи, что этот человек был не просто торговцем, а еще и английским шпионом и контрабандистом. Английские военные галеоны давали свободный проход кораблям Керри в обмен на сведения о маршрутах судов, ходивших под флагами враждебных держав или принадлежавших католическим странам, и о возможностях налета на эти суда. Похоже, этот ирландец сумел подкупить администрацию порта, и оттуда к нему поступали сообщения о том, когда и куда отправлялись означенные корабли и какие грузы везли они в своих трюмах.
Инквизитор Антонио Пиньятелли довел все это до сведения государственного секретаря и секретных служб Pима в письме, адресованном кардиналу Палуцци. Священный Альянс постановил послать на Мальту пятерых агентов с заданием разорвать сеть, которой Керри оплел этот остров. Монахи-шпионы решили это дело, похитив одного из портовых чиновников, и тот, под угрозой быть преданным в руки Святой инквизиции, признался, что получал хорошую мзду за то, что передавал Керри сведения о заходе кораблей в порт и выходе их из порта Мальты. В этом деле были замешаны и несколько агентов по перевозке грузов.
Палуцци решил покончить с ирландцем как с главарем шпионской сети и дал своим агентам соответствующие инструкции. Однажды вечером, когда Керри шел пешком во французское посольство, на пути ему повстречались четыре человека, вооруженные шпагами и кинжалами. Через пару минут тело ирландского торговца и шпиона было брошено в воды Средиземного моря. Узнав о гибели и исчезновении Керри, его агенты перестали работать, а агенты Священного Альянса спокойно покинули Мальту. Длинная рука церкви еще раз дотянулась до ее врагов.
