2001 год стал годом потрясений для «Локомотива» и начался с необычных для клуба африканских приобретений. Команду пополнили нигерийский нападающий Джеймс Обиора, южноафриканский защитник Джейкоб Лекхето, на фоне которых рядовым показался приход Сергея Игнашевича, не особо выделявшегося и в предыдущем клубе «Крылья Советов». Однако и с ним Сёмин вновь попал точно в «яблочко». Как и с Маратом Измайловым.
«Когда Марат в межсезонье, играя за дубль, чуть ли не в одиночку обыграл наш основной состав — 4:1 в двусторонней игре, я не находил себе места, — вспоминал Сёмин. — Пришел в номер гостиницы, схватился за голову и долго сидел неподвижно не в силах понять: то ли у меня такая слабая команда, то ли Бог послал мне наряду с Лоськовым еще одно редкое дарование».
В пяти первых турах первенства «Локомотив» не знал поражений, а после его победы над «Динамо» подал в отставку друг и постоянный соперник Сёмина в высшем дивизионе Валерий Газзаев. Однако затем в игре железнодорожников наступил спад. Впервые, пожалуй, за всю тренерскую карьеру Сёмина пошли слухи о его грядущей отставке. Видимо, дошли они и до игроков, ив 11-м туре «Локо» в блестящем стиле разгромил «Зенит» — 5:1! Сиявший после такого успеха Николай Аксененко поспешил развеять досужие сплетни.
— Мы верим Сёмину, — заявил он. — Все разговоры о его отставке — не более чем провокация со стороны недругов «Локомотива». Затруднения команды, без сомнения, носили временный характер.
В июне железнодорожники оправдали надежды министра, в драматическом матче с «Анжи» завоевав Кубок России. На 90-й минуте матча счет открыл будущий локомотивец Нарвик Сирхаев, однако на 4-й добавленной минуте Заза Джанашия его сравнял, а победу «Локомотив» вырвал в серии послематчевых пенальти. «Мы выиграли за счет характера», — подвел итог финальному поединку Сёмин.
А в августе «Локомотив» вновь стартовал в Лиге чемпионов с 3-го квалификационного раунда. На «своем» поле в Раменском железнодорожники убедительно переиграли команду Станислава Черчесова, австрийский «Тироль» — 3:1. Бывший вратарь сборной России, находившийся в запасе, так комментировал игру:
— Когда Кирхлер сравнял счет, я грешным делом подумал, что худшее для нас позади. Оказалось, что все только начинается. Давно не видел «Локомотив» в серьезном деле и должен сказать, что нынешняя команда произвела на меня самое благоприятное впечатление. Юрий Сёмин как думающий тренер на месте не стоит, и если раньше «Локомотив» славился в основном своими разрушительными действиями, то сейчас в его составе куда больше созидателей. Отсюда и явный прогресс в игре коллектива.
