2 ноября лидер «Ленинград» закончил ремонт. В полночь он отошел от стенки завода, буксиры привели его в Гутуевский ковш. В 7.20 лидер открыл огонь по живой силе противника в районе деревни Мал. Виттолово на дистанции 120 кб. В тот же день в 19.20 лидер вышел из Ленинграда в Кронштадт, вслед за кораблями второго отряда, направлявшимися на Ханко. 21.20 лидер стал на якорь на Большом Кронштадтском рейде. На следующий день второй отряд ушел в море, а «Ленинград» остался в Кронштадте.
«Урал» и «А. Жданов» имели схожие тактико-технические характеристики. В 1926–1929 гг. на Северной верфи Ленинграда были построены шесть однотипных грузопассажирских рефрижераторных теплоходов, в том числе «Феликс Дзержинский» и «Андрей Жданов». «Феликс Дзержинский» в 1939 г. был передан в состав военно-морского флота, переоборудован в минный заградитель и переименован в «Урал». «Андрей Жданов» после начала войны был мобилизован и переоборудован в санитарный транспорт для перевозки 700 раненых. Недостатками «Урала» и «А. Жданова» были малая скорость (12,5 узла) и наличие всего одного гребного винта, что затрудняло маневрирование. Кроме того, на них отсутствовали параваны-охранители.
«Урал» до 5 ноября стоял на Неве у набережной Жореса. В этот день в 17.00 была получена телефонограмма от командующего КБФ с приказом: «Пройти мосты, стать на якорь ниже моста Лейтенанта Шмидта и ждать указаний. С вами пойдет теплоход „Жданов“». В 17.37 на корабль прибыл командир минзага капитан 1-го ранга И. Г. Карпов, буквально сбежавший из госпиталя, и вступил в командование. 6 ноября в 6.05 корабль снялся с якоря и швартовов и с помощью четырех буксиров двинулся вниз по Неве. Пройдя три моста, в 12.05 он встал на якорь у завода «Судомех». На «Урале» был значительно сокращенный экипаж (часть команды в конце октября направили в пехотные части на Невскую Дубровку).
7 ноября Сталин и Шапошников подписали директиву Ставки ВГК Военному Совету Ленинградского фронта (копия наркому ВМФ) о выводе войск с Ханко. Она была краткой: «Требуем от вас вывоза всех войск сухопутных и морских и материальной части с Ханко, пока Финский залив еще не замерз». В тот же день корабли отряда получили приказ командующего КБФ на участие в перевозке войск с Ханко.
В 16.50 7 ноября к борту «Урала» был подведен плавкран и рабочие приступили к срезанию стенег. Спустя два часа работы были закончены, срезано по 11 м на каждой мачте. Стеньги были срезаны и у «А. Жданова», одновременно на корабли установили УКВ-радиостанции. В 21.02 «Урал» снялся со швартовов и якоря, развернулся с помощью двух буксиров и в 21.54 пошел вниз по Неве. По Морскому каналу «Урал» шел вместе с транспортом «А. Жданов», преодолевая молодой лед. 8 ноября в 1.30 минзаг и транспорт стали на якорь на кронштадтском рейде.
