В 1897 году 31 августа на колокольню был поднят еще больший колокол весом 1690 пудов (вместе с языком). Его отлили в Москве на заводе П. Н. Финляндского, доставили в Киев по железной дороге; 800 саперов «нижних чинов» переместили колокол с железнодорожной станции в обитель и установили на Большой колокольне.
Колокольня славилась своими башенными часами. Павел Алеппский в книге «Путешествие Антиохийского патриарха Макария в Россию…» пишет, что еще в середине XVII века часы размещались на деревянной тогда колокольне обители.
Когда построили каменную Большую колокольню, то уже по традиции на ней в 1744 году установили часы П. Я. Чернявского. Позже их заменили сначала часами мастера Адама Левинского, а затем мастера Дзигармистра, но и они проработали недолго. В 1789 году установили часы — копию тех, что ходили на колокольне Троице-Сергиевой Лавры; их изготовил тульский оружейник и часовщик И. И. Кобылин. Они простояли больше века, и только в 1903 году их заменили часы московского мастера А. А. Енодина.
…В самом конце XVIII века, в 1797 году, возводится новая колокольня Софийского собора в Тобольске. Ее автор, местный инженер Ф. Уткин, создал величественное многоярусное сооружение высотой 75 метров. Колокольня решена в стиле своего времени — в строгих формах классицизма. Завершается высокий столп легкой фонарной надстройкой с крестом, которая размещена на восьмидольном куполе. На площадку первого яруса звона ведет винтовая кирпичная лестница. Здесь находился самый большой тысячепудовый колокол, отлитый в 1738 году на Тагильском заводе. Этот мощный и очень звучный гигант называли не иначе как «Сибирский царь-колокол». Тщательно подобранные пятнадцать колоколов издавали удивительно мелодичный звон. У каждого из них своя история: четыре колокола — подарок царей Алексея Михайловича, Феодора Иоанновича и Петра Алексеевича.
Среди колоколов есть и уникальные, древние, отлитые еще в XVII веке известным московским мастером литейного искусства Федором Моториным, их вес скромнее, но для тех времен он впечатляет — пятьсот и триста пудов.
Уместно напомнить, что именно на Софийской соборной колокольне в Тобольске находился некоторое время знаменитый ссыльный угличский колокол, но в страшный пожар 1677 года та колокольня сгорела, и тогда возвели новую.
С 1809 года на колокольне красовались часы, отбивавшие каждые четверть часа. Их автор, Илья Баянов — человек редчайших способностей, местный Кулибин; по основной профессии он был ямщиком.
