В центре дело обстояло не так хорошо. Сама по себе переправа оказалась для фаланги делом чрезвычайно трудным. Некоторое время ни одна из сторон не могла продвинуться. Потом, вследствие быстрого наступления Александра, на правом фланге образовался опасный разрыв. Греки на персидской службе не могли упустить такого случая. Построив свои силы клином, они атаковали македонян. Завязалась яростная схватка, в которой погибли Птолемей, сын Селевка, и еще около 120 македонян.
Между тем Александр, обойдя персов слева, ударил со своей конницей в тыл наемникам и царской личной гвардии. Теперь он и его люди хотели любой ценой пленить или убить Дария. Царь олицетворял собой центр возможного военного сопротивления в будущем. Если бы его не стало, дело персов оказалось бы почти безнадежным.
Увидев колесницу Дария, Александр со своими людьми бросился вперед, чтобы захватить ее. Брат Дария Оксатр, начальник придворной конницы, ринулся на защиту. Начался жестокий бой. Сам Александр был ранен в ногу (как утверждают, самим персидским царем). В этот момент возникла опасность, что лошади колесницы Дария понесут ее прямо на вражеских воинов. Дарий, забыв в этих обстоятельствах о церемониале, сам ухватился за поводья. Однако кто-то тут же нашел для него легкую колесницу. Царь, спасаясь от прямой опасности, пересел в нее и бежал с поля боя.
Центр и левый фланг Александра находились в это время в большой опасности, и ему оставалось лишь отсрочить преследование. Он построил свой правый фланг клином и атаковал наемников с фланга, заставив их отступить за реку с большими потерями. Когда кавалеристы Набарзана увидели разгром своего центра и узнали о бегстве царя, они повернули коней и последовали за ним. Отступление вскоре превратилось в бегство.
Как только опасность для фаланги и фессалийцев миновала, Александр со своими гвардейцами решил продолжить преследование персидского царя. Но Дарий уже оторвался примерно на полмили; к тому же дорога, которую он выбрал, была заполнена дезорганизованными остатками персидской армии. Преследователи углубились на территорию противника миль на двадцать пять, и, лишь когда стемнело, Александр со своими людьми повернул назад. Дарий во время бегства вскоре оставил колесницу, пересев на коня, и вместе с колесницей бросил свои царские регалии, по которым его можно было узнать. Все они, вместе с его щитом и луком, достались Александру.
Он вернулся в свой лагерь около полуночи и только приступил к ужину, как услышал плач и причитания в одном из соседних шатров. Александр послал туда человека выяснить, что происходит. Оказалось, что один из евнухов Дария, увидев его колесницу и регалии, решил, что царь погиб, и теперь мать, жена и дети царя оплакивали своего повелителя. Александр поспешил их разуверить и утешить. Он также сообщил, что воюет с Дарием не из личной вражды, а «ради независимости Азии» и что их титулы, статус и положенное содержание родственников царя будут сохранены.
