Сюжет предполагал развитие. Слишком много нарушений выявляла газета и слишком мизерна была реакция на них, чтобы не понять, что один из важнейших тормозов на пути восстановления справедливости — наша система надзора, прокуратура. Так "Новый Петербургъ" вышел на тему — городу нужен прокурор. Статья под заголовком "Петербургу нужен прокурор" была опубликована 14 января в первом номере 1999 года и стала лейтмотивом всех выступлений этого года и причиной всех дальнейших мытарств журналистов питерской газеты.
Через неделю после выхода газеты возбуждается уголовное дело против спецкора газеты Андрущенко и против автора нашей газеты Юрия Шутова. Шутова через месяц арестовывают, обвинив во всех громких убийствах последних лет, а Андрущенко пугают, — проводя обыски в газете, у него на квартире (ночью!!!), ведут допросы, наконец, когда он уезжает в отпуск, — предъявляют обвинение и тут же ОБЪЯВЛЯЮТ В РОЗЫСК как "опасного преступника". Над Андрущенко нависает вполне реальная угроза ареста и помещения в следственный изолятор. И только активные действия общественности, адвокатов и самого журналиста заменяют эту меру на подписку о невыезде, что само по себе наносит газете существенный ущерб.
Жаркое лето 1999 запомнилось не столько жарой, сколько ощущением постоянной опасности. Связано это было с тем, что начавшие падать на "Новый Петербургъ" "снаряды" стали ложиться в одну воронку. Редколлегия не считала нужным после ареста Шутова отворачиваться от него и делать вид, что не знает его. Сразу же после ареста его друзья переправили в газету его интервью с самим собой, оно было опубликовано. По законам постсоветского времени это было неслыханно. Еще с коммунистических времен пресса считала обязанным публиковать по таким поводам только одно мнение — мнение прокуратуры. А тут опубликовали мнение заключенного, в котором Шутов приводил сенсационные сведения: оказывается, ведет следствие человек с больной психикой, арест и обвинение Шутова "заказали" бандиты организованной преступной группировки, и прокуратура выполнила их заказ за деньги. Даже если бы это была неправда, — согласно п. 5 ст. 10 "Закона о прокуратуре РФ", это необходимо было проверить на вышестоящем прокурорском уровне. Но в наши чудные времена безвременья и безвластья все письма, которые отправлялись из газеты в Генпрокуратуру, во все правительственные учреждения, в Госдуму, в администрацию президента — переправлялись обратно в Санкт-Петербург. А после их "проверки" самими виновными чиновниками было возбуждено уголовное дело по статье "клевета" против... главного редактора нашей народной газеты. С самим источником информации о криминальной деятельности прокуратуры, то есть с Юрием Шутовым, при этом не счел нужным встретиться ни один следователь. "Проверка" с самого начала носила обвинительный характер в адрес газеты.
